מוכנים לסיכומים?

ביולוגיה מולקולרית - כל השיעורים

לחצו על שורה כדי לנווט לנושא

נושא קישורים

מבוא לביולוגיה מולקולרית

DNA ו-RNA, הדוגמה המרכזית, זיווג בסיסים, הסליל הכפול, Tm, היברידיזציה, מבנים מיוחדים וכלי ביוטכנולוגיה חשובים.

יסודות DNA / RNA

שיבוט DNA, טופולוגיה וסופרקוילינג

אקסו ואנדונוקלאזות, אנזימי רסטריקציה וליגאז, DNA רקומביננטי, טופולוגיית DNA, סופרקוילינג, הנוסחה Lk = Tw + Wr וג'ל אלקטרופורזה.

שיטות טופולוגיה

ארגון הגנום, כרומוזומים, כרומטין ואפיגנטיקה

ארגון הגנום, מבנה הכרומוזום, כרומטין, טופולוגיה, וריאנטים של היסטונים ורגולציה אפיגנטית.

גנום אפיגנטיקה

מבנה העל של הכרומטין וארגון מרחבי בגרעין

הטרוכרומטין ואאוכרומטין, ארגון הכרומטין במרחב הגרעיני, Hi-C, TADs, קומפרטמנטים A ו-B, טריטוריות כרומוזומליות ומעבר אינטרפאזה-מיטוזה.

כרומטין ארגון מרחבי

צנטרומרים, קוהזין, סגרגציה ומבוא להכפלת DNA

מבנה ותפקוד הצנטרומר, תפקיד הקוהזין בסגרגציה של כרומטידות אחיות, וההסבר המולקולרי לעליית שכיחות תסמונת דאון עם גיל האם, כולל עיקרון ההכפלה הסמי-קונסרבטיבית וניסוי מסלסון ושטאל.

גנום DNA

מזלג ההכפלה, אנזימי ההכפלה ורגולציה של הכפלת DNA

אתרי ראשית הכפלה, הרכבת מזלג הרפליקציה, מקטעי אוקזקי, החלפת פריימרים ומחלות הנגרמות מהתרחבות חזרות טרינוקלאוטידיות.

DNA גנום

תרגול לבוחן אמצע

שאלות עם פתרונות והסברים על תוכן השיעורים לתרגול אינטראקטיבי, כולל מבנה ה-DNA, אנזימי רסטריקציה, טופולוגיית DNA וארגון הגנום.

תרגול בחנים

ספריות DNA ו-Next Generation Sequencing

ספריות DNA, ריצוף Sanger, עקרונות NGS, הכנת ספריות, בחירת מקטעים לפי גודל, וסוגי ספריות כמו RNA-seq, ‏ChIP-seq, ‏ATAC-seq ו-Hi-C.

חלק ב׳ NGS ספריות DNA

אי יציבות גנומית ונזקי DNA ברמת הבסיס

נזקי DNA ואי יציבות גנומית, הקשר לסרטן ולהזדקנות, גורמים חיצוניים ופנימיים לנזק, נזקי בסיס כמו דה-פורינציה, דה-אמינציה ואוקסידציה, תיקון BER ומיפוי AP sites ו-‎8-oxoG.

חלק ב׳ אי יציבות גנומית BER

שעתוק ועיבוד

שעתוק בחיידקים, RNA פולימראז, פרומוטורים, אלונגציה, טרמינציה, שעתוק באאוקריוטים, RNA פולימראז II, פרומוטורים, אלונגציה, ספלייסינג ו-CTD של RNA פולימראז II.

חלק ג׳ שעתוק

תרגום ובקרת ביטוי גנים

מבנה הריבוזום, תרגום, אלונגציה, סיום תרגום, רגולציה של תרגום, מבנה tRNA, קודון התחלה, קודון סיום.

חלק ג׳ תרגום

מילון מונחים

מילון מונחים ביולוגיים מולקולריים, כולל הסברים למונחים כמו DNA, ‏RNA, כרומוזום, כרומטין, סופרקוילינג, רפליקציה, שעתוק, תרגום, אפיגנטיקה, נזקי DNA, תיקון DNA ועוד.

חלק ד׳ מילון

ביבליוגרפיה

  • Molecular Biology of the Cell, 7th Edition

לא מפסיקים לחדש

אינדקס ביולוגיה מולקולרית - רשימת מונחים

29 דקות קריאה
אינדקס מסכם לשיעורי ביולוגיה מולקולרית: ספריות DNA ו-NGS, נזקי DNA ותיקון, שעתוק, עיבוד RNA, תרגום ובקרת ביטוי גנים.

שיעורים 23-22 - בקרת ביטוי גנים

18 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על בקרת ביטוי גנים באאוקריוטים: פקטורי שעתוק, כרומטין, alternative splicing, מיקום mRNA, בקרת תרגום, פירוק mRNA וחלבונים, lncRNA, ‏Xist, ‏miRNA ו-siRNA.

שיעורים 21-20 - תרגום

11 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על תרגום באאוקריוטים: mRNA, ‏tRNA והריבוזום, הקוד הגנטי, Wobble, aminoacyl-tRNA synthetase, ‏initiation, elongation, ‏termination, polyribosomes, קיפול חלבונים, chaperones, ‏ubiquitination והפרוטאזום.

שיעור 19 - עיבוד RNA

11 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על עיבוד RNA באאוקריוטים: ‎5′ capping, מודיפיקציות mRNA, ‏polyadenylation, ‏splicing והספלייסוזום, ‏alternative splicing, בקרת איכות ו-NMD, עיבוד rRNA והרכבת ריבוזומים, ועיבוד tRNA כולל CCA ומודיפיקציות אנטיקודון.

שיעור 18 - RNA Pol I ו-RNA Pol III

14 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על RNA polymerase I ו-RNA polymerase III: מבנה הפולימראזים, שעתוק rRNA בגרעינון, ארגון גני rDNA, יצירת PIC ב-Pol I, יצירת ‏47S pre-rRNA, טרמינציה ו-reinitiation, וכן שעתוק tRNA, ‏5S rRNA ו-U6 snRNA על ידי Pol III.

שיעור 17 - שעתוק באאוקריוטים ו-RNA Pol II

13 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על RNA polymerase II, מבנה הפולימראז, CTD, פרומוטורים אאוקריוטיים, GTFs, mediator, רגולציה מרחבית, איתחול, promoter-proximal pausing, התארכות וטרמינציה.

שיעור 16 - שעתוק בחיידקים

9 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על ההבדלים בין DNA ל-RNA, עקרונות השעתוק, RNA polymerase, שעתוק בחיידקים, sigma factor, שלבי האתחול, התארכות וסיום, אופרונים ואנטיביוטיקות שפוגעות בשעתוק.

שיעור 15 - עקרונות כלליים בתיקון DNA ויציבות גנומית

9 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על העקרונות המשותפים למנגנוני תיקון DNA, תזמון לפי מחזור התא, פתולוגיות וטיפולים מבוססי DNA damage, נזקי DNA יזומים וספריות DNA למיפוי נזקים.

שיעור 14 - V(D)J recombination, ‏RAG והיפרמוטציה סומטית

12 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על נזקי DNA יזומים במערכת החיסון, V(D)J recombination, ‏RAG, ‏RSS, ‏cryptic RSS, H3K4me3, ‏AID, ‏somatic hypermutation, ‏affinity maturation ו-DIVAC.

שיעור 13 - Homologous Recombination, ‏ATM, ‏BRCA ו-VDJ recombination

14 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על תיקון שברי DNA דו-גדיליים, NHEJ, ‏homologous recombination, ‏ATM, ‏53BP1, ‏BRCA1/2, ‏PARP inhibitors, זיהוי שברים ב-DNA ופתיחה ל-VDJ recombination.

שיעור 12 - MSI, שברי DNA ומעכבי PARP

12 דקות קריאה
סיכום בביולוגיה מולקולרית על MMR deficiency, microsatellite instability, MSI-high cancers, MSI test, Lynch syndrome, single-strand breaks, PARP1, PARP inhibitors, double-strand breaks ותחילת NHEJ.

שיעור 11 - Bulky DNA Lesions, ‏TLS ו-Mismatch Repair

12 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על bulky DNA lesions, ‏pyrimidine dimers, ‏photoreactivation, ‏nucleotide excision repair, ‏Xeroderma pigmentosum, ‏translesion synthesis, ‏XP-V, ‏template switching ו-mismatch repair.

שיעור 10 - אי-יציבות גנומית ונזקי DNA ברמת הבסיס

13 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על אי-יציבות גנומית, הקשר לסרטן ולהזדקנות, גורמים לנזקי DNA, נזקי בסיס כמו דה-פורינציה, דה-אמינציה ואוקסידציה, Base Excision Repair ומיפוי AP sites.

שיעור 9 - המשך ספריות DNA ואנליזת NGS

16 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על RNA-seq, ניקוי RNA, ‏rRNA depletion, ‏Poly-A capture, אנליזת NGS, ‏alignment, ‏peak calling, ‏transcriptomics ו-Nanopore sequencing.

שיעור 8 - ספריות DNA ו-NGS

13 דקות קריאה
סיכום שיעור בביולוגיה מולקולרית על ספריות DNA, ריצוף Sanger, עקרונות NGS, הכנת ספריות, Size Selection ו-ChIP-seq.

הצעת פתרון - שאלות תרגול לקראת בוחן אמצע

68 דקות קריאה
שאלות תרגול בביולוגיה מולקולרית: הדוגמה המרכזית, מבנה DNA, זיווג בסיסים, כיווניות 5'←3', דו-גדיל אנטי-פרללי, גרובים, Tm, היברידיזציה, RNA לעומת DNA, ואנזימי רסטריקציה וליגאז.

שיעור 7 - טלומרים וטופואיזומראז

10 דקות קריאה
שיעור בביולוגיה מולקולרית על בעיית הקצוות, טלומרים, טלומראז וטופואיזומראז, לצד יישומים קליניים ומעבדתיים כמו PCR, qPCR, סנגר, NGS ו-Nanopore.

שיעור 6 - מזלג רפליקציה, טלומרים וטופואיזומרז

9 דקות קריאה
סיכום על שכפול DNA: ראשית הכפלה, ORC ו-MCM, הליקאז וטופואיזומראז, מקטעי אוקזקי, החלפת פריימרים, Fragile X והבדלים בין חיידקים לאאוקריוטים.

שיעור 5 - צנטרומרים, קוהזין, סגרגציה ומבוא להכפלת DNA

13 דקות קריאה
מבנה ותפקוד הצנטרומר, תפקיד הקוהזין בסגרגציה של כרומטידות אחיות, וההסבר המולקולרי לעליית שכיחות תסמונת דאון עם גיל האם, כולל עיקרון ההכפלה הסמי-קונסרבטיבית וניסוי מסלסון ושטאל שהוכיח אותו.

שיעור 4 - מבנה העל של הכרומטין

6 דקות קריאה
הטרוכרומטין ואאוכרומטין, ארגון הכרומטין במרחב הגרעיני, שיטת Hi-C לניתוח ארגון הכרומטין, TADs, קומפרטמנטים A ו-B, טריטוריות כרומוזומליות, ומעבר אינטרפאזה-מיטוזה.

שיעור 3 - ארגון הגנום: כרומוזומים, כרומטין ואפיגנטיקה

13 דקות קריאה
ארגון הגנום: כרומוזומים, כרומטין ואפיגנטיקה. חזרה על טופולוגיה, מבנה הכרומוזום, כרומטין, וריאנטים של היסטונים ורגולציה אפיגנטית.

שיעור 2 - שיבוט DNA, טופולוגיית DNA וסופרקוילינג

7 דקות קריאה
סיכום בביולוגיה מולקולרית על אקסו ואנדונוקלאזות, אנזימי רסטריקציה וליגאז, DNA רקומביננטי, טופולוגיית DNA, סופרקוילינג, נוסחת Lk=Tw+Wr וג'ל אלקטרופורזה.

שיעור 1 - מבוא לביולוגיה מולקולרית

10 דקות קריאה
סיכום בביולוגיה מולקולרית על מבנה ותפקוד DNA ו-RNA, הדוגמה המרכזית, זיווג בסיסים, הסליל הכפול, Tm, היברידיזציה, מבנים מיוחדים וכלי ביוטכנולוגיה חשובים.
מדעי החיים
קורסי כימיה
כימיה אורגנית
ביוכימיה
מדעים מדויקים
פיזיקה א׳
פיזיקה ב׳
אנטומיה ופיזיולוגיה
אנטומיה
רפואה וחברה