מילון מונחים - התפתחות עוברית
המילון מאחד את המונחים המרכזיים משיעורים 1–14. ההגדרות נכתבו לפי ההקשר שבו המונח מופיע בקורס.
הצבעים מסמנים שושלת התפתחותית או מערכת איתות. גוונים קרובים מציינים ענפים קרובים באותה משפחה. לחיצה על מונח מציגה קשרים מפורשים למונחים אחרים במילון.
Ectoderm
Surface ectoderm Neuroectoderm Neural plate border ← Neural crest
Mesoderm
Axial Paraxial Lateral plate Cardiac
Endoderm
Foregut Midgut Hindgut
ICM → Epiblast TE → Trophoblast PrE → VE / Parietal endoderm Wnt Nodal FGF Hedgehog Notch Ectoderm + Mesoderm Endoderm + Mesoderm שיטה קליני
סה״כ: 588 מונחים מאוחדים משיעורים 1–14.
מושגי יסוד ושיטות מחקר
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| אמבריולוגיה (Embryology) | תחום החוקר כיצד זיגוטה מתפתחת לעובר מאורגן בעל רקמות, איברים וצירי גוף. | מושג כללי | 1–14 |
| Embryogenesis | כלל התהליכים שבהם הזיגוטה יוצרת מגוון תאים, צירי גוף, רקמות ואיברים. | תהליך | 1 |
| Blueprint | תוכנית התפתחותית המגדירה אילו מבנים ייווצרו, היכן ובאיזה סדר. | מושג כללי | 1 |
| Generation | הזמן מן ההפריה ויצירת האורגניזם ועד הגעתו לבגרות מינית וליכולת להעמיד דור חדש. | מושג כללי | 1 |
| Cellular diversity | מגוון סוגי התאים שנוצר באמצעות Differentiation מתוך גנום משותף. | מושג כללי | 1 |
| Continuity of life | המשכיות בין דורות באמצעות יצירת קו נבט וגמטות המסוגלות להעמיד דור חדש. | מושג כללי | 1 |
| Differentiation - התמיינות | רכישת זהות ותפקוד ייחודיים היוצרת מגוון תאי מתוך תאים בעלי פוטנציאל רחב יותר. | תהליך | 1, 4 |
| Morphogenesis - מורפוגנזה | יצירת צורה ומבנה באמצעות תנועות תאים, שינויי צורה, הידבקות וארגון מרחבי. | תהליך | 1 |
| Organogenesis - אורגנוגנזה | ארגון שכבות הנבט לרקמות ולאיברים; הוא מתחיל עוד לפני שהגסטרולציה הסתיימה בכל העובר. | תהליך | 1, 10–14 |
| Symmetry | מצב שבו שני צדדים או אזורים מקבילים דומים בארגונם. | ציר / כיוון | 1, 6 |
| Asymmetry | הבדל מאורגן בין צדדים או אזורים, הנדרש למשל לקביעת ימין–שמאל. | ציר / כיוון | 1, 6, 13–14 |
| Body axis - ציר גוף | מערכת כיוונים המארגנת את מיקום הרקמות והאיברים בעובר. | ציר / כיוון | 1, 6–14 |
| Anterior–Posterior axis | הציר שבין קדמת העובר לזנבו. | ציר / כיוון | 6, 8–14 |
| Dorsal–Ventral axis | הציר שבין הגב לבטן. | ציר / כיוון | 6–8, 11–12 |
| Left–Right axis | הציר המבדיל בין צד שמאל לצד ימין וקובע אסימטריה של איברים. | ציר / כיוון | 7, 9, 13–14 |
| Proximal–Distal axis | ציר המתאר קרבה או ריחוק מאזור ייחוס; ב־Egg cylinder הוא עובר מה־ExE אל הקצה הדיסטלי. | ציר / כיוון | 7–10 |
| Embryonic–Abembryonic axis | הציר בבלסטוציסט בין הקוטב שבו נמצא ה־ICM לבין הקוטב הנגדי. | ציר / כיוון | 4, 6 |
| Ligand - ליגנד | מולקולת אות הנקשרת לרצפטור ומתחילה או משנה תגובה תאית. | עקרון בסיגנלינג | 1–3, 8–14 |
| Receptor - רצפטור | חלבון הקולט ליגנד וממיר את הקישור לאות תוך־תאי. | עקרון בסיגנלינג | 1–3 |
| Signaling pathway | שרשרת אירועים מולקולריים המעבירה מידע מחוץ לתא אל מנגנוני תגובה ושעתוק. | עקרון בסיגנלינג | 1–3 |
| Morphogen | אות התפתחותי שעוצמה או משך חשיפה שונים אליו גורמים לתאים להפעיל תוכניות גורל שונות. | עקרון בסיגנלינג | 1, 8, 10–14 |
| Morphogen gradient | שינוי הדרגתי בריכוז או בפעילות של מורפוגן לאורך רקמה. | עקרון בסיגנלינג | 1, 8, 10–14 |
| Diffusion - דיפוזיה | תנועה נטו של מולקולות מאזור בריכוז גבוה לאזור בריכוז נמוך. | תהליך | 1–2, 14 |
| Autocrine signaling | אות שהופרש מתא ופועל על אותו תא. | עקרון בסיגנלינג | 1 |
| Paracrine signaling | אות המופרש ופועל על תאים סמוכים. | עקרון בסיגנלינג | 1 |
| HSPG | Heparan sulfate proteoglycans; חלבוני ליבה הנושאים שרשראות heparan sulfate וקושרים ליגנדים, וכך מווסתים את פיזורם, יציבותם והצגתם לרצפטורים. | עקרון בסיגנלינג | 1–2 |
| Syndecan | HSPG טרנסממברנלי: חלבון הליבה חוצה את הממברנה ונושא שרשראות heparan sulfate מחוץ לתא. | עקרון בסיגנלינג | 1 |
| Glypican | HSPG המחובר לממברנה בעוגן GPI ויכול לרכז ליגנדים על פני התא. | עקרון בסיגנלינג | 1 |
| HSPG sulfation | הוספת קבוצות sulfate לשרשראות heparan sulfate; דפוס הסולפציה משנה את האפיניות לליגנדים ואת צורת הגרדיאנט. | עקרון בסיגנלינג | 1 |
| Positive feedback | משוב שבו תוצר המסלול מחזק את המשך פעילותו או את זהות התא שנוצרה. | עקרון בסיגנלינג | 3, 5, 8, 14 |
| Negative feedback | משוב שבו תוצר המסלול מפחית את פעילותו וכך מגביל עוצמה או משך. | עקרון בסיגנלינג | 2–3, 12 |
| Cross-talk | השפעה של מסלול איתות אחד על רכיבים או תוצרים של מסלול אחר. | עקרון בסיגנלינג | 2 |
| Signal initiation | השלב שבו קישור ליגנד לרצפטור מתחיל את העברת האות. | עקרון בסיגנלינג | 1–3 |
| Signal amplification | הגברת אות ראשוני קטן באמצעות הפעלה של מספר רב של מולקולות downstream. | עקרון בסיגנלינג | 1–3 |
| Signal shut-off | מנגנונים המפסיקים את התגובה, כגון פירוק ליגנד, אינטרנליזציית רצפטור, פוספטאזות ומשוב שלילי. | עקרון בסיגנלינג | 1–3 |
| Redundancy - יתירות | מצב שבו כמה גנים או רכיבים מסוגלים לפצות זה על זה, ולכן פגיעה ברכיב יחיד אינה תמיד יוצרת פנוטיפ. | מושג כללי | 4, 9 |
| Loss of function (LOF) | הפחתה או ביטול של פעילות גן כדי לבדוק אם הוא נדרש לתהליך או לפנוטיפ. | שיטת מחקר | 4–5, 9, 11–14 |
| Gain of function (GOF) | הוספה, הגברה או הפעלה אקטופית של פעילות גן כדי לבדוק מה היא מסוגלת לגרום והאם היא מספיקה לתוצאה מסוימת. | שיטת מחקר | 4, 9, 12 |
| Knockout (KO) | ביטול גנטי של גן או של פעילותו. | שיטת מחקר | 4–5, 11–14 |
| Conditional knockout | ביטול גן ברקמה או בזמן מוגדרים, לרוב באמצעות Cre-loxP. | שיטת מחקר | 13 |
| Null allele | אלל שאינו מייצר תוצר פונקציונלי. | שיטת מחקר | 7 |
| Wild type (WT) | הגנוטיפ או הפנוטיפ התקין המשמש להשוואה לניסוי. | שיטת מחקר | 7, 12, 14 |
| Rescue experiment | החזרת פעילות גן לרקע מוטנטי ובדיקה אם הפנוטיפ משתפר; תיקון הפנוטיפ מחזק את הקשר הסיבתי בין אובדן הגן לתוצאה. | שיטת מחקר | 14 |
| Transgenic embryo | עובר שאליו הוכנס רצף גנטי מתוכנן לצורך ביטוי, סימון או בדיקת בקרה. | שיטת מחקר | 6, 14 |
| Reporter gene | גן שסיגנל מדיד שלו, כגון GFP או LacZ, מדווח היכן ומתי רצף בקרה פעיל. | שיטת מחקר | 6, 10, 14 |
| Knock-in | החדרה מכוונת של רצף למיקום מוגדר בגנום, למשל חיבור GFP לגן אנדוגני. | שיטת מחקר | 6, 14 |
| Chimera - כימרה | עובר המורכב מתאים שמקורם ביותר מעובר או מגנוטיפ אחד. | שיטת מחקר | 6, 10 |
| Cell lineage analysis | מעקב אחר תא וצאצאיו כדי לקבוע לאילו רקמות הם תורמים. | שיטת מחקר | 6 |
| Fate map | מפה המקשרת בין מיקום תאים מוקדם לבין הגורל ההתפתחותי העתידי שלהם. | שיטת מחקר | 9 |
| Marker - סמן | גן, RNA או חלבון המשמש לזיהוי סוג תא, מצב או גורל; סמן מזהה אוכלוסייה אך לבדו אינו מוכיח שהוא קובע את גורלה. | שיטת מחקר | 4–14 |
| Immunostaining | שימוש בנוגדנים מסומנים לזיהוי מיקום וכמות של חלבון ברקמה. | שיטת מחקר | 1, 4–5 |
| DAPI | צבען פלואורסצנטי הנקשר ל־DNA ומשמש לסימון גרעינים. | שיטת מחקר | 3–4, 11 |
| GFP | חלבון פלואורסצנטי ירוק המשמש כסמן לביטוי גנים או לשושלת תאים. | שיטת מחקר | 6 |
| LacZ | גן מדווח המקודד β-galactosidase; פעילותו נראית לאחר צביעה מתאימה. | שיטת מחקר | 10, 14 |
| X-gal | סובסטרט היוצר משקע כחול בנוכחות β-galactosidase ולכן חושף ביטוי LacZ. | שיטת מחקר | 10, 14 |
| RNA in situ hybridization | זיהוי מרחבי של RNA ברקמה באמצעות גלאי משלים מסומן. | שיטת מחקר | 8, 11–12 |
| Whole-mount in situ hybridization | RNA in situ המתבצע בעובר שלם ומציג את דפוס הביטוי התלת־ממדי של RNA. | שיטת מחקר | 8 |
| Antisense RNA probe | גלאי RNA משלים ל־mRNA המטרה; קישורו מאפשר לזהות היכן התעתיק נמצא בעובר. | שיטת מחקר | 8 |
| DIG | Digoxigenin; תווית כימית נפוצה לסימון גלאי RNA ב־in situ hybridization. | שיטת מחקר | 8 |
| FISH | Fluorescence in situ hybridization; זיהוי רצפי DNA או RNA באמצעות גלאים פלואורסצנטיים. | שיטת מחקר | 7 |
| RT-PCR / qPCR | ב־RT-PCR ממירים RNA ל־cDNA ומגבירים רצף מטרה; RT-qPCR מודדת את ההגברה בזמן אמת ומאפשרת לכמת את כמות ה־RNA ההתחלתית. | שיטת מחקר | 7 |
| NGS | ריצוף מקבילי בהיקף גדול המשמש לבדיקת וריאנטים או ביטוי גנים. | שיטת מחקר | 7 |
| aCGH | השוואת כמות DNA על גבי מערך לזיהוי חסרים או תוספות כרומוזומליים. | שיטת מחקר | 7 |
| Cell-autonomous | השפעה התלויה בפעילות הגן בתוך התא עצמו. | מושג כללי | 4 |
| Cell non-autonomous | השפעה על תא הנגרמת מאות או מפעילות בתאים אחרים. | מושג כללי | 4 |
מסלול Wnt
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| Wnt | משפחת ליגנדים המווסתת גורל תאים, קוטביות, נדידה ויצירת צירים. | מסלול Wnt | 1–2, 8–13 |
| Porcupine (PORCN) | אנזים ב־ER שמוסיף ל־Wnt חומצת שומן בקשר O-acylation; המודיפיקציה דרושה לקישור ל־Wntless, להפרשה ולפעילות תקינה. | מסלול Wnt | 2 |
| O-acylation | הוספת חומצת שומן לשייר serine דרך אטום חמצן; ב־Wnt המודיפיקציה מבוצעת על ידי Porcupine ונדרשת להפרשה ולקישור לרצפטור. | מסלול Wnt | 2 |
| Wntless (Wls) | חלבון טרנסממברנלי המעביר Wnt מהגולג’י לממברנה ומסייע בהפרשתו. | מסלול Wnt | 2 |
| sFRP | Secreted Frizzled-related protein; קושר Wnt. בהתאם להקשר הוא יכול להתחרות על הליגנד ולעכב את המסלול, או לשאת Wnt שומני ולאפשר את פיזורו בין תאים. | Wnt - מעכב | 1–2 |
| WIF-1 | Wnt inhibitory factor 1; מעכב מופרש הקושר Wnt ומפחית את זמינותו לרצפטור. | Wnt - מעכב | 1 |
| Exosome | שלפוחית חוץ־תאית קטנה היכולה לשאת ליגנדים כגון Wnt בין תאים. | מסלול Wnt | 2 |
| Cytoneme | שלוחה תאית דקה וארוכה המעבירה ליגנדים ישירות בין תאים מרוחקים. | מסלול Wnt | 2 |
| Canonical Wnt | המסלול התלוי בייצוב β-catenin ובשינוי שעתוק דרך TCF/LEF. | מסלול Wnt | 1–2 |
| Non-canonical Wnt | מסלולי Wnt שאינם נשענים על β-catenin, למשל מסלולי קוטביות או סידן. | מסלול Wnt | 2 |
| Ror2 / Ryk | קו־רצפטורים המשמשים במסלולי Wnt לא־קנוניים ומעבירים אותות של קוטביות ושלד התא ללא β-catenin. | מסלול Wnt לא־קנוני | 2 |
| Frizzled | הרצפטור המרכזי לליגנדי Wnt. | מסלול Wnt | 1–2 |
| LRP5/6 | קו־רצפטור של Wnt קנוני המשתתף בגיוס רכיבי המסלול לממברנה. | מסלול Wnt | 1 |
| Destruction complex | קומפלקס המזרחן β-catenin ומכוון אותו לפירוק כאשר אין Wnt. | מסלול Wnt | 1 |
| Axin | חלבון פיגום מרכזי ב־Destruction complex המקרב את β-catenin, APC, CK1 ו־GSK-3β. | מסלול Wnt | 1–2 |
| APC | רכיב ב־Destruction complex המסייע לקשור β-catenin ולהעבירו לזרחון ולפירוק. | מסלול Wnt | 1–2 |
| CK1 | Casein kinase 1; מתחיל את רצף הזרחון של β-catenin ב־Wnt OFF ומשתתף גם בעיבוד Gli במסלול Hedgehog. | מסלולי Wnt / Hedgehog | 1–3 |
| GSK-3β | קינאז בקומפלקס ההרס המזרחן β-catenin ומקדם את פירוקו. | מסלול Wnt | 1 |
| β-catenin / CTNNB1 | חלבון בעל שני תפקידים: רכיב ב־Adherens junctions וקו־אקטיבטור במסלול Wnt קנוני. | מסלול Wnt | 1–2, 4 |
| Armadillo repeats | האזור המרכזי החוזרני של β-catenin, המשמש משטח קישור ל־TCF/LEF, ל־cadherins ולחלבונים נוספים. | מסלול Wnt / Adherens junctions | 1 |
| TCF/LEF | פקטורי שעתוק הקושרים β-catenin ומפעילים גני מטרה של Wnt. | מסלול Wnt | 1 |
| Groucho | קו־רפרסור הנקשר ל־TCF כאשר אין β-catenin ומדכא גני מטרה. | Wnt - מעכב | 1 |
| Wnt OFF | מצב ללא ליגנד: קומפלקס ההרס פעיל, β-catenin מתפרק וגני המטרה מדוכאים. | Wnt - מצב כבוי | 1 |
| Wnt ON | מצב עם ליגנד: קומפלקס ההרס מעוכב, β-catenin מצטבר ונכנס לגרעין. | Wnt - מצב פעיל | 1 |
| DKK1 | מעכב מופרש של Wnt הנקשר ל־LRP ומסייע בסילוקו מהממברנה; חשוב להגנת האזור הקדמי. | Wnt - מעכב | 1, 10 |
| Kremen | רצפטור המסייע ל־DKK לקדם אינטרנליזציה של LRP. | Wnt - מעכב | 1 |
| ZNRF3 / RNF43 | E3 ubiquitin ligases ממברנליים המפחיתים Frizzled מן הממברנה. | Wnt - מעכב | 1–2 |
| R-spondin (RSPO) | חלבון מופרש שמחזק Wnt באמצעות נטרול ZNRF3/RNF43; בהיעדר LGR הוא יכול גם לקדם סילוק של רצפטור BMP מן הממברנה. | Wnt - מגביר | 1–2 |
| LGR | רצפטור ל־R-spondin; יצירת קומפלקס RSPO–LGR מסלקת את ZNRF3/RNF43 מפעילות על Frizzled. | Wnt - מגביר | 1–2 |
מסלולי TGF-β, BMP ו־Nodal
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| TGF-β superfamily | משפחת ליגנדים הכוללת BMPs, Activins ו־Nodal ופועלת דרך רצפטורי serine/threonine kinase ו־Smad. | משפחת BMP / TGF-β | 2, 8 |
| GDF | Growth differentiation factor; תת־משפחה בתוך TGF-β superfamily הקרובה ל־BMPs. | TGF-β superfamily | 2, 8 |
| BMP | Bone morphogenetic protein; משפחת אותות חשובה לדפוסי גוף, גורלות מזודרם, נוירולציה וסומיטים. | משפחת BMP / TGF-β | 1–2, 8–12 |
| BMP2 | ליגנד ממשפחת BMP המופיע בקורס כדוגמה להפעלת מסלול BMP. | משפחת BMP / TGF-β | 2 |
| BMP4 | ליגנד BMP מרכזי מן ה־ExE ובהמשך מרקמות לטרליות; משתתף ב־PGCs, מזודרם ודפוסי סומיטים. | משפחת BMP / TGF-β | 8, 10–12 |
| Type II receptor | רצפטור TGF-β פעיל קינאזית שמזרחן ומפעיל רצפטור Type I לאחר קישור ליגנד. | משפחת BMP / TGF-β | 2 |
| Type I receptor | רצפטור שמופעל על ידי Type II ומזרחן R-Smads. | משפחת BMP / TGF-β | 2 |
| Smad1/5/8 | R-Smads המזורחנים בעיקר downstream של BMP receptors. | מסלול BMP | 2 |
| Smad2/3 | R-Smads המופעלים בעיקר downstream של Activin/Nodal receptors. | מסלול Nodal / Activin | 2, 8, 13 |
| BMP receptor 1A | רצפטור Type I של BMP; RSPO יכול לקדם את האינטרנליזציה שלו כאשר LGR אינו זמין. | משפחת BMP / TGF-β | 2 |
| R-Smad | Receptor-regulated Smad; Smad המזורחן ישירות על ידי רצפטור Type I. | משפחת BMP / TGF-β | 2 |
| Co-Smad / Smad4 | שותף אוניברסלי ל־R-Smads היוצר עמם קומפלקס שעתוק ונכנס לגרעין. | משפחת BMP / TGF-β | 2 |
| I-Smad | Inhibitory Smad; Smad6/7 המעכבים את הרצפטור או מגייסים מנגנוני פירוק. | BMP - מעכב | 2 |
| Pro-domain | החלק בקודמן של ליגנד TGF-β המסייע לקיפול ולהפרשה ומוסר בביקוע פרוטאוליטי. | TGF-β superfamily | 2, 8 |
| Proprotein convertase | פרוטאז המבקע pro-ligands באתר מוגדר ומפריד בין ה־pro-domain לצורה הבוגרת. | TGF-β superfamily | 2, 8 |
| Mature ligand | הדומיין הבוגר שנשאר לאחר הביקוע ויוצר את הליגנד הפעיל, בדרך כלל כדימר. | TGF-β superfamily | 2, 8 |
| Smurf | E3 ubiquitin ligase המגויס על ידי I-Smad ומקדם פירוק של רכיבי הרצפטור. | BMP - מעכב | 2 |
| Noggin | מעכב BMP מופרש הקושר את הליגנד ומונע ממנו להגיע לרצפטור. | BMP - מעכב | 2, 11 |
| V-shape | קונפורמציה פתוחה של קומפלקס ליגנד–רצפטורים המאפשרת ל־Type II לזרחן את Type I. | משפחת BMP / TGF-β | 2 |
| Closed-shape | קונפורמציה סגורה של קומפלקס הרצפטורים לפני השינוי המאפשר הפעלה מלאה. | משפחת BMP / TGF-β | 2 |
| Nodal | ליגנד ממשפחת TGF-β המעצב את ה־DVE/AVE, הגסטרולציה ואת ציר ימין–שמאל. | מסלול Nodal | 8–10, 13–14 |
| Activin | ליגנד ממשפחת TGF-β המשתמש במסלול דומה ל־Nodal ומפעיל Smad2/3. | מסלול Nodal | 8 |
| Cripto | קו־רצפטור ממשפחת EGF-CFC המחובר לממברנה בעוגן GPI. הוא נדרש ל־Nodal, בעוד Activin יכול להפעיל את הרצפטורים ללא Cripto. | מסלול Nodal | 8, 13 |
| EGF-CFC family | משפחת קו־רצפטורים הכוללת Cripto; חלבונים אלה מחוברים לממברנה בעוגן GPI ומאפשרים Nodal signaling. | מסלול Nodal | 8, 13 |
| Pro-Nodal | הצורה הלא־מבוקעת של Nodal. בניגוד לרוב ה־pro-ligands במשפחת TGF-β, גם היא פעילה - אך חלשה מן הצורה הבוגרת. | מסלול Nodal | 8 |
| Furin | Proprotein convertase המבקע Pro-Nodal; יכול להיות מופרש מתאים סמוכים ולפעול גם מחוץ לתא. | מסלול Nodal | 8, 13 |
| PACE4 | Proprotein convertase נוסף המעבד Pro-Nodal ויכול להשלים את פעילות Furin. | מסלול Nodal | 8, 13 |
| Lefty | מעכב מופרש של Nodal המתפזר מהר יותר ומגביל את האות בזמן ובמרחב. | Nodal - מעכב | 8–10, 13–14 |
| Lefty1 | Lefty המתבטא בעיקר בקו האמצע ויוצר מחסום בין צד שמאל לצד ימין. | Nodal - מעכב | 8–9, 13–14 |
| Lefty2 | Lefty המתבטא בצד שמאל של ה־LPM ומגביל את תחום ומשך פעילות Nodal. | Nodal - מעכב | 13–14 |
| Cerberus / Cer1 | מעכב מופרש של מסלולים כגון Nodal, BMP ו־Wnt; משתתף בהגדרת האזור הקדמי. | Nodal - מעכב | 1, 8–10 |
מסלול FGF, RTK ו־Ras/MAPK
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| FGF | Fibroblast growth factor; משפחת ליגנדים המווסתת גדילה, הישרדות, EMT, מזודרם וסומיטוגנזה. | מסלול FGF / RTK | 1–2, 5, 10–12 |
| FGFR | רצפטור tyrosine kinase לליגנדי FGF. | מסלול FGF / RTK | 2, 5, 10 |
| RTK | Receptor tyrosine kinase; רצפטור המזרחן שיירי טירוזין לאחר דימריזציה. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| Receptor dimerization | קירוב שני רצפטורי RTK בעקבות קישור ליגנד, המאפשר ל־domains הקינאזיים לזרחן זה את זה. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| Constitutive activity | פעילות של חלבון או רצפטור גם ללא האות שאמור להפעיל אותו; מוטציה כזו יכולה להחזיק מסלול במצב ON. | עקרון בסיגנלינג | 2 |
| Trans-autophosphorylation | לאחר דימריזציה כל דומיין קינאז מזרחן שיירי טירוזין ברצפטור השכן; לכן מדובר בזרחון הדדי בתוך הדימר. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| Docking site | שייר מזורחן המשמש אתר קישור לחלבוני אדפטור או אנזימים. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| FGFR D1/D2/D3 | שלושת הדומיינים החוץ־תאיים דמויי immunoglobulin של FGFR; D2/D3 משתתפים בקישור ליגנד. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| Alternative splicing of FGFR | שחבור חליפי, בעיקר בדומיין D3, משנה את הספציפיות של FGFR לליגנדי FGF שונים. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| Acid box | אזור חומצי ב־FGFR המווסת אינטראקציות וקישור HSPG. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| PLC-γ | אנזים המופעל על ידי RTK ומבקע PIP2 ל־IP3 ול־DAG. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| PIP2 | פוספוליפיד ממברנלי: PLC-γ מבקע אותו ל־IP3 ול־DAG, ואילו PI3K מזרחן אותו ל־PIP3. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| IP3 | תוצר מסיס של ביקוע PIP2 המעודד שחרור סידן מן ה־ER. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| DAG | תוצר ממברנלי של ביקוע PIP2 המפעיל חלבונים כגון PKC. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| PKC | Protein kinase C; משפחת קינאזים המופעלת downstream של DAG ולעיתים גם Ca²⁺. | מסלול FGF / PLC-γ | 2 |
| PI3K | קינאז המוסיף פוספט ל־PIP2 ויוצר PIP3, ובכך מגייס חלבוני איתות לממברנה. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| PIP3 | פוספוליפיד איתות שנוצר על ידי PI3K ומשמש אתר עגינה לחלבונים בעלי PH domain. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| FRS2α | אדפטור הנקשר ל־FGFR ומגייס רכיבים למסלולי Ras/MAPK ו־PI3K. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| GRB2 | אדפטור המחבר רצפטור או FRS2 למפעילים של Ras ולרכיבי PI3K. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| GAB1 | חלבון אדפטור המסייע בגיוס PI3K למסלול FGF. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| Ras | GTPase קטנה הפעילה בקישור GTP ומתחילה את שרשרת Raf–MEK–ERK. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| GDP/GTP switch | Ras כבוי כשהוא קשור ל־GDP ופעיל כשהוא קשור ל־GTP. | מסלול FGF / RTK | 2–3 |
| GEF | Guanine nucleotide exchange factor; מחליף GDP ב־GTP ומפעיל GTPase. | מסלול FGF / RTK | 2–3 |
| SOS | GEF מרכזי המפעיל Ras. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| GAP | GTPase-activating protein; מאיץ הידרוליזת GTP ומכבה GTPase. | מסלול FGF / RTK | 2–3 |
| Raf | MAPKKK המופעל על ידי Ras ומזרחן MEK. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| MEK | MAPKK המזרחן את ERK. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| ERK / MAPK | הקינאז הסופי בשרשרת Ras–Raf–MEK–ERK המשנה פעילות חלבונים ושעתוק. | מסלול FGF / RTK | 2, 5 |
| ELK / FOS | פקטורי שעתוק downstream של ERK המתרגמים פעילות MAPK לשינוי בביטוי גנים. | מסלול FGF / Ras–MAPK | 2 |
| SHP2 | פוספטאז המחזק Ras–MAPK, בין היתר באמצעות הסרת אתרי קישור המעודדים גיוס של Ras-GAP ל־FRS2. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| Sprouty | מעכב משוב פנימי של FGF/Ras–MAPK. | FGF - משוב מעכב | 2 |
| SEF / IL17RD | מעכב של מסלול FGF המפחית העברת אות אל ERK. | FGF - משוב מעכב | 2 |
| Pyk / Fer | קינאזות במורד RTK היכולות לזרחן רכיבי adherens junctions ולשנות קישור α-catenin. | מסלול FGF / RTK | 2 |
| Rho GTPases | GTPases קטנות המווסתות שלד תא, קוטביות, כיווץ ונדידה. | מסלול FGF / RTK | 2, 10 |
מסלולי Hedgehog ו־Notch
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| Hedgehog family | משפחת ליגנדים הכוללת Shh, Ihh ו־Dhh. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Sonic Hedgehog (Shh) | ליגנד מורפוגני מרכזי בדפוסי צינור העצבים, סומיטים ואיברים נוספים. | מסלול Hedgehog | 3, 11 |
| Indian Hedgehog (Ihh) | ליגנד נוסף ממשפחת Hedgehog. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Desert Hedgehog (Dhh) | ליגנד נוסף ממשפחת Hedgehog. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Patched / Ptch1 | הרצפטור ל־Hedgehog; בהיעדר ליגנד הוא מעכב את Smoothened. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Ptch2 | רצפטור נוסף ממשפחת Patched היכול לקשור Hedgehog ולווסת Smoothened. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Smoothened (Smo) | חלבון בעל שבעה מקטעים טרנסממברנליים המעביר את אות Hedgehog לאחר ש־Patched חדל לעכבו; הוא דמוי-GPCR אך אינו רצפטור GPCR קלאסי. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Gli full-length (GliFL) | הצורה המלאה של פקטור השעתוק Gli לפני הפיכתו לרפרסור או לאקטיבטור. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Gli1 / Gli2 / Gli3 | שלושת פקטורי השעתוק העיקריים של Hedgehog ביונקים; Gli2 פועל בעיקר כאקטיבטור, Gli3 בעיקר כרפרסור, ו־Gli1 הוא בעיקר גן מטרה ואקטיבטור. | מסלול Hedgehog | 3, 11 |
| SUFU | Suppressor of fused; קושר GliFL ומווסת את מיקומו ואת עיבודו לרפרסור או לאקטיבטור. | מסלול Hedgehog | 3 |
| GliR | צורה מקוצרת ורפרסורית של Gli הנוצרת בהיעדר Hedgehog. | Hedgehog - רפרסיה | 3 |
| GliA | הצורה האקטיבטורית של Gli full-length הנשמרת כאשר Hedgehog פעיל ומפעילה גני מטרה. | Hedgehog - אקטיבציה | 3 |
| Primary cilium | שלוחה תאית יחידה המבוססת לרוב על אקסונמה 9+0 ומשמשת מרכז איתות. רבות מהסיליות הראשוניות אינן מוטיליות, אך סיליות ה־Pit cells ב־Node הן 9+0 ומוטיליות. | סיליה / מנגנון תנועה | 3, 9, 13–14 |
| Axoneme | שלד המיקרוטובולים הפנימי של סיליה. | סיליה / מנגנון תנועה | 3 |
| 9+0 axoneme | תשעה doublets היקפיים ללא זוג מרכזי; אופייני לרוב הסיליות הראשוניות וגם לסיליות ה־Node. | סיליה / מבנה | 3, 13–14 |
| 9+2 axoneme | תשעה doublets היקפיים וזוג מיקרוטובולים מרכזי; מבנה אופייני לרבות מהסיליות המוטיליות בדרכי הנשימה. | סיליה / מבנה | 3, 13 |
| Transition zone | מחסום סלקטיבי בבסיס הסיליה הכולל Y-links ומווסת אילו חלבונים נכנסים למדור הסיליארי. | סיליה / מבנה | 3 |
| Basal body | צנטריולה מותאמת המעגנת את הסיליה לממברנה וממנה נבנית האקסונמה. | סיליה / מבנה | 3 |
| A-tubule / B-tubule | שני המיקרוטובולים המרכיבים doublet באקסונמה; A מלא ו־B חלקי. | סיליה / מנגנון תנועה | 3 |
| IFT-A / IFT-B | Intraflagellar transport complexes הנושאים חלבונים לאורך האקסונמה; IFT-B קשור בעיקר לתנועה אנטרוגרדית ו־IFT-A לרטרוגרדית. | סיליה / הובלה | 3 |
| Kinesin | מנוע מיקרוטובולרי המוביל מטעני IFT מן הבסיס אל קצה הסיליה. | סיליה / הובלה | 3 |
| Dynein-2 | מנוע ציטופלזמטי המוביל רכבות IFT מקצה הסיליה חזרה לבסיס. | סיליה / הובלה | 3 |
| Motile cilium | סיליה שמייצרת תנועה באמצעות dynein axonemal; המבנה יכול להיות 9+2 או, ב־Pit cells של ה־Node, 9+0. | סיליה / תנועה | 3, 13–14 |
| Anterograde transport | תנועת IFT מן הבסיס אל קצה הסיליה בכיוון ה־plus end, בעיקר בעזרת kinesin. | סיליה / מנגנון תנועה | 3 |
| Retrograde transport | תנועת IFT מקצה הסיליה חזרה לבסיס בכיוון ה־minus end, בעזרת dynein. | סיליה / מנגנון תנועה | 3 |
| GPCR | G-protein-coupled receptor; רצפטור בעל שבעה מקטעים טרנסממברנליים המפעיל חלבוני G. | סיליה / מנגנון תנועה | 3 |
| Adenylyl cyclase | אנזים המייצר cAMP מ־ATP. | סיליה / מנגנון תנועה | 3 |
| cAMP | שליח שניוני המפעיל בין היתר PKA. | סיליה / מנגנון תנועה | 3 |
| PKA | Protein kinase A; במסלול Shh פעילותו תורמת ליצירת GliR. | סיליה / מנגנון תנועה | 3 |
| Cholesterol modification | חיבור קוולנטי של כולסטרול לקצה הקרבוקסילי של HhN במהלך הביקוע העצמי של קודמן Shh. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Palmitoylation | הוספת palmitate לקצה Shh, הנדרשת לפעילות מלאה. | מסלול Hedgehog | 3 |
| HhN / HhC | קודמן Hedgehog נחלק ל־HhN, הליגנד הסיגנלי, ול־HhC, דומיין המבצע את הביקוע העצמי והעברת הכולסטרול. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Autoproteolysis of Shh | ביקוע עצמי של קודמן Shh שבו HhC משחרר את HhN ומחבר אליו כולסטרול. | מסלול Hedgehog | 3 |
| HHAT / Skinny hedgehog | אצילטרנספראז המוסיף palmitate לקצה האמיני של Shh ונדרש לפעילותו המלאה. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Dispatch | חלבון ממברנלי הדרוש לשחרור Shh שעבר cholesterol modification מן התא המפריש ולהעברתו אל נשאים חוץ־תאיים. | מסלול Hedgehog | 3 |
| SCUBE | חלבון מופרש הקושר את המודיפיקציות הליפידיות של Shh ומסייע לשאתו בסביבה החוץ־תאית. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Cdon / Boc | קו־רצפטורים המסייעים לקליטת Hedgehog. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Gas1 | קו־רצפטור של Hedgehog המחובר לממברנה בעוגן GPI ומסייע להעברת Shh אל Patched. | מסלול Hedgehog | 3 |
| Notch | מסלול איתות התלוי במגע ישיר בין תאים ומשנה שעתוק באמצעות ביקוע הרצפטור. | מסלול Notch | 3, 11–12 |
| Notch1–4 | ארבעת רצפטורי Notch העיקריים ביונקים. | מסלול Notch | 3 |
| EGF-like repeats | חזרות חוץ־תאיות ברצפטור Notch המשתתפות בקישור ליגנד ובמודיפיקציות סוכר. | מסלול Notch | 3 |
| O-Fut / POFUT1 | O-fucosyltransferase המוסיף fucose ל־EGF-like repeats של Notch ומשנה את תכונות הקישור לליגנדים. | מסלול Notch | 3 |
| LNR domains | דומיינים ברצפטור Notch המסייעים למנוע הפעלה לא מבוקרת. | מסלול Notch | 3 |
| DSL domain | דומיין שמור בליגנדי Notch המתווך קישור לרצפטור. | מסלול Notch | 3 |
| Delta-like / Jagged | משפחות הליגנדים הטרנסממברנליים העיקריות של Notch; הקישור מחייב מגע ישיר בין תאים. | מסלול Notch | 3, 12 |
| TACE / ADAM protease | פרוטאז המבצע את הביקוע החוץ־ממברנלי הראשון של Notch לאחר קישור ליגנד. | מסלול Notch | 3 |
| γ-secretase | קומפלקס פרוטאוליטי המבקע Notch בתוך הממברנה ומשחרר NICD. | מסלול Notch | 3 |
| NICD | Notch intracellular domain; החלק המשתחרר ונכנס לגרעין להפעלת גני מטרה. | מסלול Notch | 3 |
| NLS | Nuclear localization signal; רצף המאפשר כניסת חלבון לגרעין. | מסלול Notch | 3 |
| TAD | Transactivation domain ב־NICD המגייס קו־אקטיבטורים ומסייע להפעלת השעתוק. | מסלול Notch | 3 |
| CSL | פקטור שעתוק של Notch; ללא NICD הוא רפרסור ועם NICD הוא הופך לקומפלקס אקטיבטורי. | מסלול Notch | 3 |
Cleavage, בלסטוציסט והחלטות גורל מוקדמות
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| Zygote - זיגוטה | התא הדיפלואידי הראשון שנוצר לאחר איחוי הגמטות. | Cleavage / קדם־השרשה | 4, 6 |
| Mitosis - מיטוזה | חלוקת תא שבה הכרומוזומים המשוכפלים מתחלקים לשני תאי בת בעלי מטען גנטי דומה. | תהליך | 4 |
| Oocyte meiotic maturation | חידוש והשלמת שלבי המיוזה באואוציט לקראת הפריה. | Cleavage / קדם־השרשה | 4 |
| Prophase I arrest | עצירת האואוציט הראשוני בפרופאזה I במשך תקופה ממושכת. | Cleavage / קדם־השרשה | 4, 7 |
| Polar body | תא קטן הנוצר בחלוקת האואוציט ומקבל כרומוזומים אך מעט ציטופלזמה. | Cleavage / קדם־השרשה | 4, 7 |
| Cleavage | סדרת חלוקות מיטוטיות מהירות ללא גדילה משמעותית בנפח העובר הכולל. | Cleavage / קדם־השרשה | 4, 6–7 |
| Blastomere | אחד התאים הנוצרים במהלך חלוקות ה־cleavage. | Cleavage / קדם־השרשה | 4, 6 |
| Morula - מורולה | גוש תאים קומפקטי לפני יצירת חלל הבלסטוציסט. | Cleavage / קדם־השרשה | 4 |
| Compaction | עלייה ב־E-cadherin, בהידבקות ובשטח המגע בין הבלסטומרים, המתחילה בעכבר סביב שלב שמונת התאים. | Cleavage / קדם־השרשה | 4–6 |
| Cavitation | יצירת Blastocoel באמצעות אטימת ה־TE ב־tight junctions, יצירת מפל יונים וכניסת מים אל חלל העובר. | Cleavage / קדם־השרשה | 4 |
| Blastocoel | החלל הנוזלי של הבלסטוציסט. | Cleavage / קדם־השרשה | 4–6 |
| Blastocyst | מבנה הכולל Trophectoderm חיצוני, ICM פנימי ו־Blastocoel. | Cleavage / קדם־השרשה | 4–8 |
| 16-cell embryo | שלב שבו מתחילה הבחנה ברורה יותר בין תאים חיצוניים לתאים פנימיים בעקבות חלוקות סימטריות וא-סימטריות. | Cleavage / קדם־השרשה | 4–6 |
| 32-cell embryo | שלב בלסטוציסט מוקדם שבו שושלות TE ו־ICM מבוססות יותר ומתחילה ההחלטה Epiblast–PrE. | Cleavage / קדם־השרשה | 4–5 |
| Zona pellucida | מעטפת גליקופרוטאינית סביב הביצית והעובר לפני ההשרשה. | Cleavage / קדם־השרשה | 4, 7 |
| Primary oocyte | אואוציט ראשוני שנעצר בפרופאזה I לפני הבשלה. | Cleavage / קדם־השרשה | 4 |
| Germinal vesicle | גרעין האואוציט הראשוני הגדול בזמן העצירה בפרופאזה I; פירוקו מסמן GVBD. | Cleavage / קדם־השרשה | 4 |
| Secondary oocyte | האואוציט לאחר השלמת Meiosis I; הוא נעצר במטאפזה II עד ההפריה. | Cleavage / קדם־השרשה | 4, 7 |
| GVBD | Germinal vesicle breakdown; פירוק מעטפת גרעין האואוציט עם חידוש המיוזה. | Cleavage / קדם־השרשה | 4 |
| Meiosis I | חלוקת ההפחתה המפרידה כרומוזומים הומולוגיים. | Cleavage / קדם־השרשה | 4 |
| Meiosis II | החלוקה המפרידה כרומטידות אחיות; באדם מסתיימת לאחר הפריה. | Cleavage / קדם־השרשה | 4 |
| Metaphase II arrest | עצירת האואוציט במטאפזה II עד כניסת הזרע. | Cleavage / קדם־השרשה | 4, 7 |
| Totipotency | יכולת של תא ליצור הן את גוף העובר והן את הרקמות החוץ־עובריות הנדרשות להתפתחות של אורגניזם שלם. | Cleavage / קדם־השרשה | 4 |
| Pluripotency | יכולת ליצור את כל שלוש שכבות הנבט ואת תאי הגוף, אך לא לבנות לבדה את כל הרקמות החוץ־עובריות הנדרשות לעובר שלם. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 4–6 |
| Self-renewal | חלוקה המייצרת לפחות תא בת אחד השומר על זהות תא הגזע ועל פוטנציאל ההתמיינות שלו. | תאי גזע | 4 |
| Stem-cell maintenance | חלוקה השומרת על גודל מאגר תאי הגזע. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 4 |
| Stem-cell expansion | חלוקה המגדילה את מאגר תאי הגזע. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 4 |
| Stem-cell exhaustion | אובדן הדרגתי של מאגר תאי הגזע עקב התמיינות ללא חידוש מספיק. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 4 |
| Embryonic stem cells | תאים פלוריפוטנטיים שמקורם ב־ICM וניתנים לגידול בתרבית. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 4 |
| Inner cell mass (ICM) | קבוצת התאים הפנימית בבלסטוציסט שממנה יתפתחו האפיבלסט וה־Primitive endoderm. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 4–6 |
| Trophectoderm (TE) | האפיתל החיצוני של הבלסטוציסט; הוא יוצר את שושלת ה־trophoblast ואת הרכיב העוברי המרכזי בשליה. | שושלת חוץ־עוברית - TE/Trophoblast | 4–7 |
| Trophoblast | שם כללי לשושלת הטרופואקטודרם ולנגזרותיה לאחר ההשרשה. | שושלת חוץ־עוברית - TE/Trophoblast | 4, 7 |
| Polar trophectoderm | TE הסמוך ל־ICM ותורם בין היתר ל־ExE. | שושלת חוץ־עוברית - TE/Trophoblast | 6–8 |
| Mural trophectoderm | TE המרוחק מן ה־ICM ומקיף את רוב ה־Blastocoel. | שושלת חוץ־עוברית - TE/Trophoblast | 6–7 |
| First cell fate decision | ההפרדה בין תאים חיצוניים המתפתחים ל־TE לבין תאים פנימיים המתפתחים ל־ICM. | תהליך | 4–6 |
| Second cell fate decision | ההפרדה בתוך ה־ICM בין Epiblast לבין Primitive endoderm. | תהליך | 4–5 |
| Epiblast | האוכלוסייה הפלוריפוטנטית שממנה נוצר גוף העובר וכל שלוש שכבות הנבט. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 4–10 |
| Primitive endoderm (PrE) | שושלת ב־ICM התורמת ל־Visceral ול־Parietal endoderm. | שושלת PrE | 4–8 |
| Oct4 / POU5F1 | פקטור שעתוק מרכזי לשמירת פלוריפוטנטיות וזהות ICM/Epiblast. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 4–6 |
| Nanog | פקטור שעתוק המקדם זהות Epiblast ופלוריפוטנטיות. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 4–6 |
| Cdx2 | פקטור שעתוק מרכזי לשימור ולייצוב זהות Trophectoderm; בהמשך הוא מדכא את תוכנית Oct4/Nanog בתאים החיצוניים. | שושלת חוץ־עוברית - TE/Trophoblast | 4–6 |
| Gata6 | פקטור שעתוק מוקדם של Primitive endoderm. תאי Gata6-high נעשים רגישים יותר ל־FGF ומתקדמים לעבר גורל PrE. | שושלת PrE | 4–5 |
| Gata4 | פקטור שעתוק מאוחר יותר של Primitive endoderm, המופיע לאחר התבססות ההחלטה לעומת Gata6 המוקדם. | שושלת PrE | 4–5 |
| Salt-and-pepper expression | דפוס מעורב שבו תאי Nanog-high ותאי Gata6-high מפוזרים זה לצד זה לפני מיון. | תהליך | 4 |
| Cell sorting | ארגון מחדש של תאים לפי זהות והידבקות ליצירת שכבות מסודרות. | תהליך | 4 |
| Outgrowth culture | גידול עובר או חלק ממנו בתרבית לבדיקת יכולת היצמדות, התרבות והתמיינות. | שיטת מחקר | 4–6 |
| Keratin 8 (K8) | סמן אפיתליאלי המשמש לזיהוי תאי Trophectoderm. | שושלת חוץ־עוברית - TE/Trophoblast | 4 |
קומפקציה, פולריות ו־Hippo
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| Epithelial cell | תא בעל קוטביות אפיקלית–בזאלית, קשרים בין־תאיים וממברנה בזלית; תאים כאלה יוצרים יריעה רציפה. | מבנה תא / אפיתל | 5, 8–10 |
| Tight junction | צומת אוטם בין תאים המגביל מעבר פארא-תאי ושומר על מחסום אפיתליאלי. | מבנה תא / אפיתל | 5, 10 |
| Adherens junction | צומת הצמדה המבוסס על cadherins ומקושר לשלד האקטין דרך catenins. | מבנה תא / אפיתל | 1–2, 5–6, 10 |
| Cadherin | משפחת חלבוני הצמדה תלויי סידן היוצרים קשרים בין תאים. | מבנה תא / אפיתל | 1 |
| E-cadherin | Cadherin אפיתליאלי מרכזי הדרוש להידבקות, Compaction ושמירת אפיתל. | מבנה תא / אפיתל | 2, 5, 10 |
| α-catenin | חלבון המקשר את קומפלקס E-cadherin/β-catenin לשלד האקטין. | מבנה תא / אפיתל | 2 |
| Filopodium | שלוחה דקה עשירה באקטין; בעובר המוקדם מסייעת לקרב בלסטומרים בזמן compaction. | מבנה תא / אפיתל | 5 |
| siRNA | RNA דו־גדילי קצר המכוון לפירוק RNA מטרה ולהפחתת ביטוי גן. | שיטת מחקר | 5 |
| Dicer | אנזים המעבד RNA דו־גדילי למולקולות siRNA קטנות. | שיטת מחקר | 5 |
| Polarization | יצירת הבדלים מאורגנים בין אזורים שונים של התא, למשל אפיקלי ובזאלי. | תהליך | 5–6 |
| Apical domain | הצד החופשי של תא אפיתל הפונה מחוץ לשכבה או לחלל. | פולריות תאית | 5 |
| Basal / basolateral domain | הדומיין הבזאלי פונה לממברנה הבזלית; הדומיין הלטרלי יוצר קשרים עם תאים שכנים. לעיתים מתייחסים אליהם יחד כ־basolateral. | פולריות תאית | 5 |
| Apical polarity complex | קומפלקס חלבונים כגון Par3, Par6 ו־aPKC המגדיר זהות אפיקלית. | פולריות תאית | 5 |
| Par3 | חלבון קוטביות אפיקלי המשתתף בארגון הקומפלקס האפיקלי. | פולריות תאית | 5 |
| Par6 | חלבון קוטביות אפיקלי הפועל עם Par3 ו־aPKC. | פולריות תאית | 5 |
| aPKC | קינאז בקומפלקס הקוטביות האפיקלי. | פולריות תאית | 5 |
| Ezrin | חלבון המקשר ממברנה לאקטין ומסמן את הדומיין האפיקלי. | פולריות תאית | 5 |
| Symmetric division | חלוקה שבה שתי הבנות מקבלות רכיבים ומיקום דומים. | תהליך | 5–6 |
| Asymmetric division | חלוקה שבה הבנות מקבלות רכיבים או מיקומים שונים ולכן עשויות לקבל גורלות שונים. | תהליך | 5–6, 11 |
| Inside–outside model | מודל שלפיו מיקום פנימי או חיצוני קובע Hippo, Cdx2 וזהות ICM או TE. | פולריות תאית | 5 |
| Hippo signaling | מסלול המווסת כניסת YAP/TAZ לגרעין וקושר בין מגעי תא לבין גורל ICM/TE. | מסלול Hippo | 5 |
| Hippo ON | בתא פנימי AMOT/NF2 מפעילים LATS; YAP/TAZ מזורחנים ונשארים בציטופלזמה, ולכן תוכנית TE אינה מופעלת. | מסלול Hippo | 5 |
| Hippo OFF | בתא חיצוני הדומיין האפיקלי מרחיק AMOT מן ה־junctions; YAP/TAZ נכנסים לגרעין ומפעילים עם TEAD את Cdx2. | מסלול Hippo | 5 |
| LATS1/2 | קינאזים המזרחנים YAP/TAZ ומונעים את כניסתם לגרעין כאשר Hippo פעיל. | מסלול Hippo | 5 |
| YAP/TAZ | קו־אקטיבטורים של TEAD; כשהם בגרעין הם מקדמים ביטוי Cdx2 וזהות TE. | מסלול Hippo | 5 |
| TEAD1–4 | פקטורי שעתוק הפועלים עם YAP/TAZ ומפעילים גנים כגון Cdx2. | מסלול Hippo | 5–6 |
| 14-3-3 | חלבון הקושר YAP/TAZ מזורחנים ושומר אותם בציטופלזמה. | מסלול Hippo | 5 |
| MST1 | MST1/2; קינאזים upstream במסלול Hippo היכולים להפעיל LATS1/2, לצד MAP4Ks. | מסלול Hippo | 5 |
| MAP4K | משפחת קינאזים המפעילה LATS בעזרת חלבוני פיגום. | מסלול Hippo | 5 |
| NF2 / Merlin | חלבון פיגום באזורי junctions המסייע להפעלת LATS. | מסלול Hippo | 5 |
| AMOT / Motins | משפחת חלבונים הקושרת F-actin ורכיבי junctions. בתאים פנימיים AMOT מגייס NF2/LATS ומסייע לשמור YAP/TAZ מחוץ לגרעין. | מסלול Hippo | 5 |
| F-actin | פולימרים של actin היוצרים את הקורטקס ואת שלד התא; AMOT וקשרי הצמדה חשים את ארגונם במסלול Hippo. | ארכיטקטורת התא | 5–6, 10–11 |
| WWC1 / KIBRA | חלבון פיגום המסייע לחבר בין junctions לבין הפעלת LATS במסלול Hippo. | מסלול Hippo | 5 |
| Zygotic genome activation (ZGA) | תחילת שעתוק פעיל מן הגנום העוברי לאחר שלבים הנשענים על RNA אימהי. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 5–6 |
| FGF4 | ליגנד שמיוצר בעיקר בתאי Nanog-high בכיוון Epiblast ופועל פאראקרינית על תאי ICM אחרים לקידום Gata6/Gata4 וגורל Primitive endoderm. | מסלול FGF / RTK | 5 |
| FGFR1 / FGFR2 | רצפטורי FGF המאפשרים לתאי ICM להגיב ל־FGF4 ולקדם Gata6/Gata4. | מסלול FGF / RTK | 5 |
שבירת סימטריה ואפיגנטיקה מוקדמת
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| Deterministic development | דגם שבו זהות התא נקבעת מוקדם יחסית לפי שושלת או רכיבים שקיבל, ולכן הסרת תא צפויה ליצור חסר קבוע. | תהליך | 6 |
| Regulative development | דגם שבו תאים מוקדמים שומרים גמישות ויכולים לשנות תרומה ולפצות חלקית על הסרת תאים או שינוי במבנה. | תהליך | 6 |
| Stochastic process | תהליך אקראי שבו אין מראש הטיה עקבית של תא מסוים לתוצאה אחת. | תהליך | 6 |
| Probabilistic development | התפתחות שבה גורל התא אינו קבוע מראש, אך הבדלים מוקדמים משנים את ההסתברות שכל תא יתרום לשושלת מסוימת. | תהליך | 6 |
| Probabilistic bias | הבדל מוקדם שאינו קובע גורל מוחלט אך מגדיל את הסיכוי לגורל מסוים. | תהליך | 6–7 |
| Animal pole | קוטב הביצית הסמוך לגופיף הקוטבי. | ציר / כיוון | 6 |
| Vegetal pole | הקוטב המרוחק מן הגופיף הקוטבי. | ציר / כיוון | 6 |
| Meridional division (M) | מישור חלוקה המקביל בקירוב לציר animal–vegetal. | ציר / כיוון | 6 |
| Equatorial division (E) | מישור חלוקה החוצה את הציר animal–vegetal בכיוון משווני. | ציר / כיוון | 6 |
| MM embryo | עובר ארבעה תאים שבו שני הבלסטומרים עברו חלוקה מרידיונלית. | ציר / כיוון | 6 |
| EE embryo | עובר ארבעה תאים שבו שני הבלסטומרים עברו חלוקה אקווטוריאלית או לא־מרידיונלית. | ציר / כיוון | 6 |
| ME/EM embryo | עובר ארבעה תאים שבו בלסטומר אחד התחלק מרידיונלית והשני אקווטוריאלית; לרוב מתקבל סידור טטרהדרלי. | ציר / כיוון | 6 |
| Tetrahedral 4-cell embryo | סידור תלת־ממדי של ארבעת הבלסטומרים שבו כל תא סמוך לאחרים; שכיח בדגם ME/EM. | ציר / כיוון | 6 |
| Monozygotic twins | תאומים שנוצרו מזיגוטה אחת שהתפצלה. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 6 |
| Dizygotic twins | תאומים שנוצרו משתי ביציות ושני תאי זרע נפרדים. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 6 |
| ART | Assisted reproductive technologies; שם כולל לטכנולוגיות רבייה מסייעות. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 6–7 |
| Acetylation | הוספת קבוצת אצטיל, לרוב להיסטונים, הקשורה בדרך כלל לכרומטין נגיש יותר. | אפיגנטיקה | 6 |
| Methylation | הוספת קבוצת מתיל ל־DNA או להיסטונים; משמעותה תלויה באתר ובחלבון המותמר. | אפיגנטיקה | 6 |
| Epigenetic code | דפוס מודיפיקציות כרומטין המשפיע על נגישות וביטוי גנים ללא שינוי רצף DNA. | אפיגנטיקה | 6 |
| Histone tail | הקצה הגמיש של היסטון הבולט מן הנוקלאוזום ועליו מתבצעות מודיפיקציות כגון אצטילציה ומתילציה. | אפיגנטיקה | 6 |
| Writer | אנזים שמוסיף מודיפיקציה אפיגנטית, למשל CARM1 או HAT. | אפיגנטיקה | 6 |
| Reader | חלבון שמזהה מודיפיקציה אפיגנטית ומגייס קומפלקסים המשנים כרומטין או שעתוק. | אפיגנטיקה | 6 |
| Eraser | אנזים שמסיר מודיפיקציה אפיגנטית, למשל HDAC המסיר acetyl groups. | אפיגנטיקה | 6 |
| HAT / HDAC | HAT מוסיף acetyl groups להיסטונים; HDAC מסיר אותם. השינוי משפיע על נגישות הכרומטין. | אפיגנטיקה | 6 |
| H3R26me | מתילציה של arginine 26 בהיסטון H3 שנקשרה בשיעור להטיה לכיוון ICM. | אפיגנטיקה | 6 |
| CARM1 | ארגינין-מתילטרנספראז המייצר H3R26me ומשפיע על ביטוי Sox2/Nanog. | אפיגנטיקה | 6 |
| Long non-coding RNA (lncRNA) | RNA ארוך שאינו מקודד חלבון אך יכול לווסת כרומטין, שעתוק או יציבות RNA. | אפיגנטיקה | 6 |
| LincGET | lncRNA מוקדם בעובר הקשור ל־CARM1 ולהטיה של תאים לכיוון ICM. | אפיגנטיקה | 6 |
| C-value paradox | היעדר התאמה פשוטה בין גודל הגנום לבין מורכבות האורגניזם. | אפיגנטיקה | 6 |
| G-value paradox | היעדר התאמה פשוטה בין מספר הגנים המקודדים חלבון לבין מורכבות האורגניזם. | אפיגנטיקה | 6 |
| Sox2 | פקטור שעתוק פלוריפוטנטי; בהמשך גם סמן של תאי אב עצביים. | שושלת עוברית - Epiblast/ICM | 5–6, 11 |
| Tfap2c | פקטור שעתוק הקשור לתוכנית Trophectoderm. | שושלת חוץ־עוברית - TE/Trophoblast | 6 |
SCMC, רבייה מסייעת והשרשה
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| SCMC | Subcortical maternal complex; קומפלקס חלבונים אימהיים מתחת לקורטקס הביצית הדרוש לחלוקות עובריות מוקדמות. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| Maternal-effect gene | גן שבו הגנוטיפ של האם קובע את פנוטיפ העובר המוקדם דרך תוצרים שהוטענו לביצית. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| FLOPED | רכיב ב־SCMC שמקורו האימהי; בעוברים מאם Floped-null החלוקות הראשונות אינן מאורגנות וההתפתחות נעצרת מוקדם. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| MATER / NLRP5 | רכיב מרכזי ב־SCMC החיוני להתפתחות לפני השרשה. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| FILIA | רכיב SCMC המשתתף ביציבות כרומוזומלית ובהתפתחות מוקדמת. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| TLE6 | רכיב מבני ב־SCMC המסייע למקם את הקומפלקס מתחת לקורטקס ולארגן חלוקות עובריות מוקדמות. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| IVF | In vitro fertilization; הפריית ביצית מחוץ לגוף ולאחריה תרבית והחזרת עובר. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| ICSI | הזרקת תא זרע יחיד ישירות לציטופלזמת הביצית. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| PGD | השם הישן ל־Preimplantation genetic diagnosis; בדיקה של עוברים לפני החזרה לרחם כאשר מחפשים מחלה או וריאנט משפחתי מוגדר. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| PGS | השם הישן ל־Preimplantation genetic screening; סקר כרומוזומלי של עוברים, המכונה כיום בדרך כלל PGT-A. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| Cleavage-stage biopsy | דגימת בלסטומר מעובר בשלב cleavage לצורך בדיקה גנטית. | שיטת דגימה / אבחון | 7 |
| Trophectoderm biopsy | דגימת כמה תאי TE מבלסטוציסט לצורך בדיקה גנטית. | שיטת דגימה / אבחון | 7 |
| Polar-body biopsy | דגימת גופיף קוטבי לבדיקת התרומה הגנטית האימהית בלבד. | שיטת דגימה / אבחון | 7 |
| Endometrium | רירית הרחם שבה מתרחשת השרשה. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Luminal epithelium | שכבת האפיתל הפונה לחלל הרחם והיא הממשק הראשון עם הבלסטוציסט. | השרשה | 7 |
| Stromal cell | תא רקמת חיבור באנדומטריום; בהשפעת Progesterone הוא יכול לעבור Decidualization. | השרשה | 7 |
| Myometrium | שכבת השריר החלק העבה של דופן הרחם. | רבייה | 7 |
| Perimetrium | השכבה הסרוזית החיצונית של הרחם. | רבייה | 7 |
| Basalis | השכבה הבזלית של האנדומטריום הנשארת ומשקמת את הרירית לאחר הווסת. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Functionalis | השכבה התפקודית של האנדומטריום המתעבה ונושרת במחזור ללא הריון. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Uterine cycle | השינויים המחזוריים באנדומטריום: וסת, שלב פרוליפרטיבי ושלב סקרטורי. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Ovarian cycle | המחזור בשחלה הכולל התפתחות זקיקים, ביוץ ושלב לוטאלי. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| GnRH | הורמון היפותלמי המגרה את ההיפופיזה להפריש FSH ו־LH. | רבייה | 7 |
| FSH | הורמון המעודד גדילת זקיקים ותפקוד Granulosa cells. | רבייה | 7 |
| LH | הורמון שהעלייה החדה בו גורמת לביוץ ולהפיכת הזקיק ל־Corpus luteum. | רבייה | 7 |
| Ovulation | שחרור ה־Secondary oocyte מן הזקיק בעקבות LH surge. | רבייה | 7 |
| Corpus luteum | מבנה זמני שנוצר מן הזקיק לאחר הביוץ ומפריש בעיקר Progesterone. | רבייה | 7 |
| Primordial follicle | זקיק שחלתי מוקדם הכולל primary oocyte המוקף שכבת תאים שטוחים. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| Folliculogenesis | הבשלה הדרגתית של הזקיק מ־Primordial follicle דרך שלבים ראשוני, שניוני ואנטרלי עד זקיק בשל. | רבייה | 7 |
| Antral / mature follicle | זקיק מתקדם בעל חלל נוזלי גדול, שממנו משתחרר ה־Secondary oocyte בזמן הביוץ. | רבייה | 7 |
| Granulosa cell | תא זקיקי התומך באואוציט ומגיב להורמונים במהלך התפתחות הזקיק. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| Estrogen | הורמון המקדם את השלב הפרוליפרטיבי של האנדומטריום. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| Progesterone | הורמון המופרש בעיקר מן הגופיף הצהוב ומקדם שלב סקרטורי ו־decidualization. | רבייה והתפתחות מוקדמת | 7 |
| Menstruation | נשירת שכבת ה־functionalis כאשר אין השרשה והריון. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Endometriosis | מצב שבו רקמה דמוית אנדומטריום מצויה מחוץ לחלל הרחם. | קליני / פתולוגי | 7 |
| Proliferative phase | שלב תלוי אסטרוגן שבו האנדומטריום נבנה מחדש ומתעבה. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Secretory phase | שלב תלוי פרוגסטרון שבו האנדומטריום נעשה סקרטורי ומוכן להשרשה. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Decidualization | שינוי תאי הסטרומה באנדומטריום לתאים דצידואליים גדולים וסקרטוריים התומכים בהשרשה ומווסתים את חדירת ה־trophoblast. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Window of implantation | פרק זמן מוגבל שבו האנדומטריום קולט בלסטוציסט באופן מיטבי. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Uterine receptivity | מצב זמני של האנדומטריום המאפשר Apposition, Adhesion ותגובה מתאימה לבלסטוציסט. | השרשה | 7 |
| Blastocyst competence | יכולת הבלסטוציסט להגיב לאותות הרחם, להיצמד ולהתחיל invasion בזמן המתאים. | השרשה | 7 |
| MUC1 | מוצין על פני ה־Luminal epithelium היוצר מחסום אנטי-היצמדות; ירידה מקומית בו מאפשרת גישה של הבלסטוציסט. | השרשה | 7 |
| Luminal closure | התקרבות דפנות חלל הרחם סביב הבלסטוציסט בעכבר, המסייעת למקמו ולהביאו במגע עם האפיתל. | השרשה | 7 |
| Apposition | המגע הראשוני והרופף בין הבלסטוציסט לאפיתל הרחם. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Adhesion | היצמדות יציבה יותר של הבלסטוציסט לאנדומטריום. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Invasion | חדירת תאי trophoblast אל תוך האנדומטריום. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| L-selectin | מולקולת היצמדות המשתתפת בשלבים מוקדמים של מגע הבלסטוציסט עם הרחם. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Cytotrophoblast | שכבת תאי trophoblast חד־גרעיניים ומתחלקים. | שושלת חוץ־עוברית - TE/Trophoblast | 7 |
| Syncytiotrophoblast | שכבה רב־גרעינית חודרנית הנוצרת מאיחוי Cytotrophoblasts ואינה מחולקת לגבולות תא ברורים. | שושלת חוץ־עוברית - TE/Trophoblast | 7 |
| Entosis | חדירת תא חי לתוך תא אחר; הוצגה בהקשר של שינויים בטרופובלסט ובהשרשה. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Pre-implantation | שלבי ההתפתחות מן ההפריה ועד לפני ההשרשה. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Post-implantation | השלבים לאחר שהעובר נקשר וחודר לרירית הרחם. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Peri-implantation | פרק הזמן סביב תחילת ההשרשה. | רירית הרחם / השרשה | 7 |
| Extraembryonic ectoderm (ExE) | רקמה חוץ־עוברית שמקורה ב־polar trophectoderm; היא סמוכה לצד הפרוקסימלי של ה־Epiblast ומפרישה אותות כגון BMP4. | שושלת חוץ־עוברית - ExE/Chorion | 7–10 |
| Egg cylinder | המבנה האופייני לעובר העכבר לאחר השרשה: Epiblast ו־ExE מסודרים כגליל ומוקפים ב־Visceral endoderm. | מבנה עוברי מוקדם | 7–10 |
| Visceral endoderm (VE) | שכבת אנדודרם חוץ־עוברית העוטפת את ה־Egg cylinder ומשפיעה על דפוסי העובר. | שושלת PrE → VE | 7–10 |
| Parietal endoderm | נגזרת Primitive endoderm המצפה מבנים חוץ־עובריים ואינה עוטפת ישירות את האפיבלסט. | שושלת PrE → Parietal endoderm | 7–8 |
| Amniotic cavity | החלל הנוצר מעל ה־Epiblast ומוקף בהמשך ב־Amnion. | קדם־גסטרולציה | 7–8 |
| Hypoblast | המקבילה האנושית הקרובה ל־Primitive endoderm; יוצרת אנדודרם חוץ־עוברי ולא את Definitive endoderm של גוף העובר. | שושלת PrE | 7–8 |
טרום גסטרולציה וגסטרולציה
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| DVE | Distal visceral endoderm; קבוצת תאי VE הנוצרת בקצה הדיסטלי בעקבות דפוס Nodal/BMP ומתחילה לנוע לכיוון הצד העתידי הקדמי. | שושלת PrE → VE | 8–9 |
| AVE | Anterior visceral endoderm; אוכלוסיית VE קדמית המפרישה מעכבים כגון Cer1, Lefty1 ו־DKK1 ומרחיקה את Primitive streak מן הצד הקדמי. | שושלת PrE → VE | 8–10 |
| Nodal activity gradient | גרדיאנט פעילות Nodal לאורך ה־Egg cylinder המכוון גורלות וצירים. | מסלול Nodal | 8, 10 |
| Wnt3 gradient | דפוס Wnt3 הגבוה יותר באזור הפוסטריורי ומסייע להתחלת Primitive streak. | גסטרולציה | 8–10 |
| Anterior | הצד הקדמי של העובר, המוגן יחסית מאותות posteriorizing על ידי AVE. | ציר / כיוון | 8–14 |
| Posterior | הצד האחורי שבו מתחיל ה־Primitive streak. | ציר / כיוון | 8–14 |
| Simple epithelium | אפיתל בעל שכבת תאים אחת. | מבנה תא / אפיתל | 8 |
| Stratified epithelium | אפיתל בעל כמה שכבות תאים. | מבנה תא / אפיתל | 8 |
| Mesenchymal cell | תא פחות מקוטב ובעל קשרים רופפים יחסית, המסוגל לנדוד במטריקס. | מבנה תא / אפיתל | 8–10 |
| EMT | Epithelial-to-mesenchymal transition; אובדן קוטביות וקשרים אפיתליאליים ורכישת יכולת נדידה. | תהליך | 8–12 |
| MET | Mesenchymal-to-epithelial transition; רכישת מאפייני אפיתל על ידי תאים מזנכימליים. | תהליך | 8–11 |
| Reverse polarity | במהלך יצירת חלל האפיבלסט הצד האפיקלי פונה פנימה אל החלל החדש, בעוד הצד הבזאלי פונה החוצה אל ה־VE. | תהליך | 8 |
| Primitive streak (PS) | מבנה פוסטריורי זמני שבו תאי Epiblast עוברים EMT ונכנסים לשכבות הפנימיות. | גסטרולציה | 8–10 |
| Gastrulation | תהליך יצירת שלוש שכבות הנבט וארגון תוכנית הגוף. | גסטרולציה | 4, 8–10 |
| Ingression | יציאה של תאים בודדים מאפיתל וכניסתם פנימה לאחר EMT. | גסטרולציה | 8–10 |
| Mesendoderm | אוכלוסיית תאים העוברת דרך ה־Primitive streak ויכולה לתת Mesoderm או Definitive endoderm בהתאם לזמן, למיקום ולאותות. | Mesendoderm | 9 |
| Ectoderm | שכבת הנבט החיצונית; יוצרת בין היתר אפידרמיס ומערכת עצבים. | אקטודרם | 9–12 |
| Mesoderm | שכבת הנבט האמצעית; יוצרת שריר, שלד, דם, לב ורקמות חיבור רבות. | מזודרם | 8–13 |
| Definitive endoderm | אנדודרם שמקורו ב־Epiblast; תאים אלה עוברים דרך ה־Primitive streak ומשתלבים בשכבת ה־VE באזור העוברי. | אנדודרם | 9–12 |
| Three germ layers | Ectoderm, Mesoderm ו־Definitive endoderm שנוצרים בגסטרולציה. | שלוש שכבות הנבט | 9–10 |
| Extraembryonic mesoderm | מזודרם התורם למבנים חוץ־עובריים כגון amnion ו־chorion. | מזודרם → חוץ־עוברי | 9–10 |
| Allantois | מבנה חוץ־עוברי מזודרמלי היוצא מן האזור הפוסטריורי ותורם לכלי הדם של חבל הטבור והשליה. | מזודרם חוץ־עוברי | 9–10 |
| Amnion | קרום חוץ־עוברי המורכב מרכיב אקטודרמלי שמקורו ב־Epiblast ומרכיב של Extraembryonic mesoderm, ומקיף את חלל מי השפיר. | מבנה משולב: Ectoderm + ExM | 6, 9 |
| Chorion | קרום חוץ־עוברי הכולל רקמות שמקורן ב־trophoblast וב־Extraembryonic mesoderm ותורם לחלק העוברי של השליה. | מבנה משולב: Trophoblast + ExM | 6, 9 |
| Axial mesoderm | מזודרם קו־אמצע הכולל את ה־Prechordal plate ואת שושלת הנוטוכורד; הוא מארגן את ציר הגוף ומשרה רקמות סמוכות. | מזודרם → Axial | 9–11 |
| Prechordal plate | מזודרם אקסיאלי קדמי העובר לפני הנוטוכורד ותורם לאינדוקציה ולדפוס של אזור הראש והמוח הקדמי. | מזודרם → Axial | 9–11 |
| Paraxial mesoderm | מזודרם משני צדי הציר שממנו נוצרים הסומיטים. | מזודרם → Paraxial | 9–12 |
| Lateral plate mesoderm (LPM) | מזודרם לטרלי המתפצל ל־Somatopleure ול־Splanchnopleure ותורם ללב, כלי דם וחללי גוף. | מזודרם → Lateral plate | 9–14 |
| Cardiac mesoderm | תחום קדמי של LPM שמקבל זהות לבבית ומייצר את Cardiac crescent ושדות הלב. | מזודרם → Cardiac | 10–13 |
| Node | אזור organizer בקצה הקדמי של ה־Primitive streak. תאים היוצאים ממנו תורמים למזודרם האקסיאלי, והסיליות שבו מתחילות את קביעת ציר ימין–שמאל. | מזודרם → Axial | 9–14 |
| Notochordal plate | שלב ביניים שבו תאי שושלת הנוטוכורד משולבים זמנית ביריעה האנדודרמלית בקו האמצע, לפני היפרדותם לנוטוכורד. | מזודרם → Axial | 9–10 |
| Notochord | מוט מזודרמלי אקסיאלי המשרה Neural plate ומפריש Shh. | מזודרם → Axial | 9–11 |
| Brachyury / T | פקטור שעתוק מרכזי ליצירת Primitive streak, מזודרם והארכת הציר. | מזודרם | 9 |
| OTX2 | פקטור שעתוק הקשור לזהות קדמית; גבולו עם Brachyury מסייע למקם את ה־PS. | זהות קדמית / ציר A–P | 9 |
| Axis duplication | יצירת ציר גוף נוסף עקב ארגון ectopic של אזור organizer או Wnt3. | תהליך | 9 |
| Snail | פקטור שעתוק המשרה EMT בין היתר באמצעות דיכוי E-cadherin. | מזודרם | 9–10 |
| FGF8 | ב־Primitive streak הוא מקדם EMT ונדידת מזודרם; ב־tailbud ה־mRNA שלו מיוצר פוסטריורית והחלבון יוצר גרדיאנט לאורך ה־PSM. | מסלול FGF / RTK | 10–12 |
| FGFR1 | רצפטור FGF הדרוש ל־EMT וליציאת תאים דרך ה־Primitive streak. | מסלול FGF / RTK | 10 |
| Mesoderm specification | קביעת תת־הסוג של המזודרם לפי זמן יציאה, מיקום ועוצמת אותות. | מזודרם | 10 |
| Early PS | השלב המוקדם של ה־Primitive streak; תאים היוצאים אז מאזורו הפרוקסימלי תורמים בין היתר ל־PGCs ול־Extraembryonic mesoderm. | גסטרולציה | 9–10 |
| Primordial germ cells (PGCs) | תאי האב של קו הנבט שיולידו ביציות או תאי זרע. | שושלת תאי המין | 8–10 |
| Blimp1 / PRDM1 | פקטור שעתוק המסמן ומקדם את זהות ה־PGCs. | שושלת תאי המין | 10 |
| Eomes | פקטור שעתוק תלוי הקשר המשתתף ביצירת endoderm ובמזודרם לבבי. | Mesendoderm | 10 |
| Mesp1 | פקטור שעתוק מוקדם המגדיר שושלות מזודרם קרדיאלי. | מזודרם → Cardiac | 10 |
| Foxa2 | פקטור שעתוק של Node, Definitive endoderm ומזודרם אקסיאלי, כולל שושלת הנוטוכורד. | גסטרולציה / סמן | 9–10, 14 |
| Sox17 | פקטור שעתוק מרכזי של Definitive endoderm ומשמש סמן לשושלת זו. | אנדודרם | 6, 9–10 |
| Goosecoid (Gsc) | פקטור שעתוק המזוהה עם organizer ו־Prechordal plate באזור הקדמי. | מזודרם → Axial | 10 |
| Basement membrane | מטריקס חוץ־תאי דק מתחת לאפיתל; פירוקו נדרש ל־ingression. | מבנה תא / אפיתל | 9–10 |
| Laminin | חלבון מרכזי בממברנה הבזלית. | מבנה תא / אפיתל | 9–11 |
| Integrin | רצפטור הצמדה למטריקס המחבר את התא לממברנה הבזלית ולשלד התא. | מבנה תא / אפיתל | 9–10 |
| Apical constriction | כיווץ טבעת actomyosin בצד האפיקלי, המצמצם את שטח הפנים האפיקלי ויוצר תא בצורת טריז. | תהליך | 9–11 |
| RhoA | GTPase שמפעילה actomyosin. ב־EMT של ה־PS מיקומה קובע את התוצאה: פעילות אפיקלית תומכת בכיווץ, ופעילות בזאלית מסייעת בפירוק חיבורי המטריקס. | מבנה תא / אפיתל | 10 |
| Actomyosin | מערכת של F-actin ו־Myosin II המייצרת כוחות כיווץ ושינויי צורה בתא וברקמה. | ארכיטקטורת התא | 10–11 |
| Myosin II | מנוע אקטין היוצר כיווץ של רשת actomyosin במהלך apical constriction ו־EMT. | ארכיטקטורת התא | 10 |
| ROCK | Rho-associated kinase; effector של RhoA המפעיל Myosin II ומחזק כיווץ. | ארכיטקטורת התא | 10 |
| Microtubules | מרכיב שלד תא המעורב בקוטביות, הובלה ושינויי צורה. | מבנה תא / אפיתל | 3, 10 |
| TSR | Thrombospondin type-1 repeat; דומיין חלבוני העובר O-fucosylation ומשפיע על פעילות חלבונים מגבילי PS. | מבנה תא / אפיתל | 10 |
| POFUT2 | אנזים המוסיף O-fucose לדומייני TSR ונדרש להבשלה של חלבונים מסוימים. | מבנה תא / אפיתל | 10 |
| FLRT3 | חלבון ממברנלי המסייע להגביל התפשטות Primitive streak ולשמור על האזור הקדמי. | מבנה תא / אפיתל | 10 |
נוירולציה ונוירוגנזה
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| Neural plate | תחום Neuroectoderm מעובה שהושרה מעל המזודרם האקסיאלי ומתקפל ליצירת Neural tube. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Neuroectoderm | אקטודרם שקיבל גורל עצבי. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Neuroepithelium | האפיתל הפסאודו־רב־שכבתי של ה־Neural plate וה־Neural tube שממנו נוצרים תאי מערכת העצבים המרכזית. | אקטודרם → Neural | 11 |
| Neural progenitor | תא אב מתחלק ב־Ventricular zone המסוגל לייצר נוירונים ובהמשך תאי גליה. | אקטודרם → Neural | 11 |
| Neuroblast | תא עצבי צעיר שיצא ממחזור התא ומתחיל לנדוד ולהתמיין לנוירון. | אקטודרם → Neural | 11 |
| Surface ectoderm | אקטודרם שאינו עצבי ויוצר בעיקר אפידרמיס. | אקטודרם → Surface ectoderm | 11 |
| Epidermis | האפיתל החיצוני של העור הנוצר מ־Surface ectoderm. | אקטודרם → Surface | 11 |
| Neural plate border | אזור הגבול בין Neural plate ל־Surface ectoderm שממנו נוצרים בין היתר Neural crest. | אקטודרם → Neural plate border | 11 |
| Neural crest | אוכלוסייה הנוצרת בגבול ה־Neural plate, עוברת EMT מגב ה־Neural tube ונודדת לרקמות רבות. | אקטודרם → Neural crest | 11 |
| Neurulation | עיצוב, קיפול ואיחוי ה־Neural plate ליצירת Neural tube והפרדתו מן ה־Surface ectoderm. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Neural groove | השקע האמצעי הנוצר במהלך קיפול ה־Neural plate. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Neural folds | שני קפלי הרקמה המתקרבים ומתאחים ליצירת Neural tube. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Medial hinge point (MHP) | נקודת כיפוף בקו האמצע מעל הנוטוכורד שבה מתרחש apical constriction. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Dorsolateral hinge points (DLHP) | נקודות כיפוף דורסו־לטרליות המסייעות לקרב את קפלי העצב. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Neural tube | הצינור האפיתליאלי שממנו מתפתחת מערכת העצבים המרכזית. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Spinal cord | החלק הקאודלי של מערכת העצבים המרכזית המתפתח מצינור העצבים. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Closure point | מוקד התחלה מקומי של איחוי קפלי העצב; מן המוקד הסגירה מתקדמת לשני הכיוונים לאורך הציר. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Neuropore | פתח זמני בקצה אזור שטרם נסגר, בין חזיתות הסגירה של ה־Neural tube. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Anterior neuropore | הפתח הקדמי הזמני של צינור העצבים. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Posterior neuropore | הפתח האחורי הזמני של צינור העצבים. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Neural tube defect (NTD) | מום הנובע מכשל בסגירת צינור העצבים. | קליני / פתולוגי | 11 |
| Anencephaly | NTD חמור הנובע מכשל בסגירה הקדמית ופוגע בהתפתחות המוח והגולגולת. | קליני / פתולוגי | 11 |
| Spina bifida | קבוצת מומים הנובעת מכשל בסגירת האזור האחורי של צינור העצבים. | קליני / פתולוגי | 11 |
| Craniorachischisis | כשל נרחב בסגירת צינור העצבים לאורך אזורי מוח וחוט שדרה. | קליני / פתולוגי | 11 |
| Neurogenesis | יצירת נוירונים ובהמשך תאי גליה מתאי האב של ה־neuroepithelium. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Ventricular zone | השכבה הסמוכה ללומן ה־Neural tube ובה מתחלקים תאי האב העצביים. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Mantle zone | שכבה חיצונית יותר שאליה נודדים נוירונים פוסט-מיטוטיים; ממנה מתפתחת בעיקר החומר האפור. | אקטודרם → Neuroectoderm | 11 |
| Roof plate | אזור קו־אמצע דורסלי בצינור העצבים המפריש אותות BMP/Wnt. | נוירואקטודרם → דורסלי | 11 |
| Floor plate | אזור קו־אמצע ונטרלי בצינור העצבים המושרה על ידי Shh ומפריש Shh. | נוירואקטודרם → ונטרלי | 11 |
| Motor neuron domain | תחום ונטרלי של תאי אב המוגדר לפי רמת Shh ומשך החשיפה אליו ומייצר נוירונים מוטוריים. | נוירואקטודרם → ונטרלי | 11 |
סומיטוגנזה ושעון הסגמנטציה
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| Somitogenesis | יצירה מחזורית של סומיטים מן המזודרם הפרה־סומיטי. | Paraxial mesoderm → Somite | 11–12 |
| Somite | יחידה אפיתליאלית סגמנטלית של Paraxial mesoderm, שממנה נוצרים מרכיבי החוליות והצלעות, שרירי השלד, חלק מן הדרמיס והגידים. | Paraxial mesoderm → Somite | 11–12 |
| Presomitic mesoderm (PSM) | מזודרם פרקסיאלי לא מסגמנטלי שממנו נוצרים סומיטים חדשים. | מזודרם → Paraxial | 11–12 |
| Tailbud | אזור פוסטריורי המוסיף תאים לציר ומייצר FGF8 במהלך התארכות העובר. | מזודרם → Paraxial | 11–12 |
| Axis elongation | הארכת העובר בכיוון ראש–זנב תוך הוספת רקמות פוסטריוריות. | ציר / כיוון | 11–12 |
| S-1 | האזור ב־PSM שבו תופעל תוכנית הסומיט הבא. | Paraxial mesoderm → Somite | 11–12 |
| S0 | הסומיט המצוי בתהליך ההיפרדות והאפיתליזציה. | Paraxial mesoderm → Somite | 11–12 |
| S1 | הסומיט החדש שכבר הופרד מן ה־PSM. | Paraxial mesoderm → Somite | 11–12 |
| Mesp2 | פקטור שעתוק מאסטר המופיע בפס קצר ב־S-1 ומפעיל את תוכנית הסגמנטציה. | Paraxial mesoderm → Somite | 10–12 |
| Sclerotome - סקלרוטום | החלק הוונטרו־מדיאלי של הסומיט; תאים ממנו עוברים EMT ויוצרים חוליות, צלעות ו־Syndetome. | Somite → Sclerotome | 11 |
| Dermomyotome | החלק הדורסלי של הסומיט שממנו נוצרים Dermatome ו־Myotome. | Somite → Dermomyotome | 11 |
| Dorsomedial lip (DML) | השפה המדיו־דורסלית של ה־Dermomyotome, מקור מרכזי לתאי Myotome ולשרירי הגב. | Somite → Dermomyotome | 11 |
| Ventrolateral lip (VLL) | השפה הוונטרו־לטרלית של ה־Dermomyotome, התורמת לשרירי דופן הגוף והגפיים. | Somite → Dermomyotome | 11 |
| Myotome - מיוטום | אוכלוסיית תאי אב שריריים היוצרת שרירי שלד. | Somite → Myotome | 11 |
| Dermatome - דרמטום | נגזרת סומיטית היוצרת חלק מן הדרמיס. | Somite → Dermatome | 11 |
| Syndetome | תחום שמקורו בסקלרוטום, הנוצר בגבול עם ה־Myotome ומייצר גידים המחברים שריר לעצם. | Somite → Syndetome | 11 |
| Myogenesis | תהליך יצירת תאי שריר וסיבי שריר. | Somite → Myotome | 11 |
| Apical delamination | יציאת תאים מן השפה של ה־Dermomyotome דרך הצד האפיקלי והוספתם ל־Myotome. | Somite → Myotome | 11 |
| Resegmentation | איחוד החצי הקאודלי של סומיט אחד עם החצי הקרניאלי של הבא ליצירת חוליה. | Paraxial mesoderm → Somite | 11 |
| Segmentation clock | מערכת גנים אוסילטוריים הקובעת מחזוריות בזמן של יצירת הסומיטים. | שעון הסגמנטציה | 11–12 |
| Clock-and-gradient model | מודל שבו שעון גנטי מחזורי פוגש חזית הבשלה המוגדרת בגרדיאנט FGF. | שעון הסגמנטציה | 11–12 |
| Clock-and-wavefront | שם חלופי למודל שבו wavefront של הבשלה מתקדם מול שעון מחזורי. | שעון הסגמנטציה | 11–12 |
| Wavefront | הגבול בין תאים פוסטריוריים לא בשלים לתאים אנטריוריים המסוגלים ליצור סומיט. | שעון הסגמנטציה | 11–12 |
| FGF8 gradient | FGF8 גבוה ב־tailbud ונמוך אנטריורית. ה־mRNA מיוצר רק פוסטריורית, והגרדיאנט נוצר בעיקר משום שהתאים נעים קדימה וה־RNA והחלבון מתפרקים. | מסלול FGF / RTK | 11–12 |
| Hes7 | פקטור שעתוק אוסילטורי המדכא את השעתוק של עצמו לאחר דיליי; בעכבר מחזור התנודה הוא בערך שעתיים. | שעון הסגמנטציה | 11–12 |
| cHairy1 | גן אוסילטורי בתרנגולת המקביל עקרונית ל־Hes7. | שעון הסגמנטציה | 12 |
| Her1 | גן שעון אוסילטורי בדג זברה ממשפחת Hairy/Hes. | שעון סגמנטציה | 12 |
| DAPT | מעכב γ-secretase החוסם שחרור NICD ומשמש ניסויית לכיבוי Notch ולבדיקת סנכרון השעון. | שיטת מחקר / Notch | 12 |
| Lunatic Fringe (Lfng) | גליקוזילטרנספראז המווסת את רגישות Notch לליגנדים. ביטויו אוסילטורי והוא מסייע לשמור תאים שכנים באותה פאזת שעון. | מסלול Notch | 12 |
| Oscillating gene | גן שרמת הביטוי שלו עולה ויורדת במחזוריות בזמן. | שעון הסגמנטציה | 11–12 |
| Transcriptional delay | השהיה בין התחלת שעתוק להופעת תוצר פעיל; חיונית ליצירת תנודות Hes7. | שעון הסגמנטציה | 12 |
| Intron-dependent delay | הזמן הדרוש לשעתוק ולשחבור אינטרונים מוסיף דיליי ללולאת המשוב של Hes7 ותומך ביצירת תנודות. | שעון סגמנטציה | 12 |
| p₀ | במודל Hes7: סף ריכוז החלבון שבו הדיכוי של שעתוק ה־mRNA מגיע למחצית מעוצמתו המרבית; זהו אינו זמן מחצית חיים. | שעון סגמנטציה | 12 |
| RNA/protein half-life | הזמן שבו מחצית מכמות RNA או חלבון מתפרקת; משפיע על תקופת האוסילציה. | שעון הסגמנטציה | 12 |
| Tm | הדיליי בין מצב החלבון הרפרסורי לבין השפעתו על שעתוק ה־mRNA במודל Hes7. | שעון הסגמנטציה | 12 |
| Tp | הדיליי בין זמינות mRNA לבין הופעת חלבון מתורגם במודל Hes7. | שעון הסגמנטציה | 12 |
| DLL3 | רכיב אטיפי במסלול Notch הקשור לסגמנטציה; בניגוד לליגנדי Delta קלאסיים הוא אינו מפעיל Notch בין תאים שכנים. | מסלול Notch | 12 |
| TBX6 | פקטור שעתוק המגדיר זהות Presomitic mesoderm ומאפשר לפולס Notch להפעיל Mesp2 באזור S-1. | מזודרם → Paraxial | 12 |
| RIPPLY2 | רפרסור המופעל downstream של Mesp2 ומדכא TBX6, וכך מסייע לכבות את חלון Mesp2 ולחדד את גבול הסומיט. | Paraxial mesoderm → Somite | 12 |
| Spondylocostal dysostosis | קבוצת מחלות מולדות עם סגמנטציה לא תקינה של חוליות וצלעות עקב פגיעה בגני השעון/Notch. | קליני / פתולוגי | 12 |
קיפול העובר, צינור העיכול והלב
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| Ventral folding | קיפול העובר לכיוון הוונטרלי ההופך משטח שטוח יחסית לגוף תלת־ממדי. | תהליך | 12 |
| Anterior folding | קיפול אזור הראש לכיוון הוונטרלי, היוצר את כיס ה־Foregut ומעביר את Cardiac crescent לעמדה ונטרלית. | קיפול העובר | 12 |
| Posterior folding | קיפול האזור הקאודלי היוצר את ה־Hindgut ומקרב את ה־PIP. | קיפול העובר | 12 |
| Lateral folding | התקרבות שני צדי העובר לכיוון קו האמצע, הסוגרת את Gut tube ואת דופן הגוף. | קיפול העובר | 12 |
| Gut formation | סגירת האנדודרם לצינור עיכול באמצעות קיפולים אנטריורי, פוסטריורי ולטרלי. | תהליך | 12 |
| Gut tube | צינור אנדודרמלי שממנו מתפתחים אפיתל מערכת העיכול ואיברים נלווים. | אנדודרם | 12 |
| Cardiac crescent | קשת מזודרם לבבי קדמית המתקרבת לקו האמצע במהלך קיפול העובר. | מזודרם → Cardiac | 12–13 |
| First heart field | אוכלוסיית מזודרם קרדיאלי התורמת בעיקר לחלקים מוקדמים של צינור הלב. | Cardiac mesoderm → First heart field | 12–13 |
| Second heart field | אוכלוסיית תאי אב קרדיאליים המוסיפה תאים לקצוות צינור הלב ותורמת למדורים נוספים. | Cardiac mesoderm → Second heart field | 12–13 |
| Somatopleure | יחידה המורכבת מ־Parietal LPM הצמוד ל־Ectoderm; היא יוצרת את דופן הגוף ומרכיבים של הגפיים. | שילוב: Ectoderm + Parietal LPM | 12 |
| Parietal LPM | העלה הסומטי של ה־Lateral plate mesoderm הצמוד ל־Ectoderm. | מזודרם → Lateral plate | 12 |
| Splanchnopleure | יחידה המורכבת מ־Visceral LPM הצמוד ל־Endoderm; היא עוטפת את Gut tube ותורמת לדופן האיברים וללב וכלי הדם. | שילוב: Endoderm + Visceral LPM | 12 |
| Visceral LPM | העלה הספלנכני של ה־Lateral plate mesoderm הצמוד ל־Endoderm. | מזודרם → Lateral plate | 12 |
| Intraembryonic coelom | החלל הנפתח בתוך ה־Lateral plate mesoderm ומפריד בין Parietal LPM ל־Visceral LPM; ממנו נוצרים חללי הגוף. | מזודרם → Lateral plate | 12 |
| Dorsal mesentery | קפל מזודרמלי המחבר את צינור העיכול לדופן הגוף הדורסלית. | מזודרם → Lateral plate | 12 |
| AIP | Anterior intestinal portal; פתח המעי הקדמי שממנו מתחילה סגירת ה־Foregut. | אנדודרם | 12 |
| PIP | Posterior intestinal portal; פתח המעי האחורי שממנו מתחילה סגירת ה־Hindgut. | אנדודרם | 12 |
| Foregut | החלק הקדמי של צינור העיכול. | אנדודרם → Foregut | 12 |
| Midgut | החלק האמצעי של צינור העיכול הנשאר זמנית מחובר לשק החלמון דרך אזור הטבור. | אנדודרם → Midgut | 12 |
| Hindgut | החלק האחורי של צינור העיכול. | אנדודרם → Hindgut | 12 |
| Ventral body-wall closure | התקרבות ואיחוי קפלי הגוף הלטרליים בקו האמצע הוונטרלי, תוך השארת Umbilical ring זמנית. | תהליך | 12 |
| Umbilical ring | הפתח הזמני בדופן הוונטרלית שדרכו עוברים חיבורים חוץ־עובריים. | פתח בדופן הגוף | 12 |
| Hepatic endoderm | תחום endoderm המקבל שילוב FGF ו־BMP ומתמיין לכבד. | אנדודרם → ניצן איבר | 12 |
| Pancreatic endoderm | תחומי endoderm דורסלי וונטרלי היוצרים את הלבלב. | אנדודרם → ניצן איבר | 12 |
| Heart tube | הצינור הראשוני הנוצר מאיחוי אזורים לבביים בקו האמצע. | מזודרם → Cardiac | 13 |
| Endocardium | האפיתל הפנימי של צינור הלב והמדורים המתפתחים; הוא מופרד מן ה־Myocardium באמצעות Cardiac jelly. | לב → Endocardium | 13 |
| Myocardium | שכבת השריר של הלב. | לב → Myocardium | 13 |
| Cardiac jelly | מטריקס חוץ־תאי בין endocardium ל־myocardium בלב המוקדם. | לב → Cardiac jelly | 13 |
| Epicardium | השכבה החיצונית של הלב המתפתחת בהמשך סביב המיוקרד. | לב → Epicardium | 13 |
| Pericardial cavity | חלל הגוף המקיף את הלב המתפתח. | חלל גוף | 13 |
| Rightward looping | כיפוף ה־Heart tube לכיוון ימין (D-looping), הממקם את אזורי החדרים וה־outflow tract ביחס לציר ימין–שמאל. | מזודרם → Cardiac | 13 |
ציר ימין–שמאל, סיליות ו־Reaction–Diffusion
| מונח | משמעות | משפחה לוגית | שיעור |
|---|---|---|---|
| Laterality | הארגון ההתפתחותי של הבדלים בין צד שמאל לצד ימין. | ציר ימין–שמאל | 13–14 |
| Early headfold stage | חלון התפתחותי מוקדם שבו Nodal סביב ה־Node וב־left LPM רגיש במיוחד לשינויים ניסויים בתזמון. | ציר ימין–שמאל | 13–14 |
| Pit cells | תאים במרכז ה־Node בעלי סיליות מוטיליות היוצרות זרם שמאלה. | סיליה / מנגנון תנועה | 13–14 |
| Crown cells | תאים בהיקף ה־Node בעלי סיליות 9+0 שאינן מוטיליות; בצד שמאל הם מגיבים לזרם דרך PKD1L1/PKD2 ומתחילים את האות הא-סימטרי. | סיליה / מנגנון תנועה | 13–14 |
| Nodal flow | זרימת נוזל שמאלה מעל ה־Node הנוצרת מסיבוב סיליות מוטיליות. | סיליות → יצירת זרימה | 13–14 |
| Two-cilia model | מודל שבו סיליות מוטיליות של Pit cells יוצרות זרם שמאלה, וסיליות לא־מוטיליות של Crown cells מתווכות את קליטת האות. | סיליה / מנגנון תנועה | 13–14 |
| Lrd / Dnah11 | Dynein מוטורי בסיליות ה־Node; פגיעה בו משבשת Nodal flow ולטרליות. | סיליה / מנגנון תנועה | 13 |
| PKD2 / PC2 | תעלת קטיונים ממשפחת polycystin הנדרשת בתוך הסיליות של Crown cells לעליית Ca²⁺ ולהפעלת התוכנית השמאלית. | סיליה / מנגנון תנועה | 13–14 |
| PKD1L1 | חלבון דמוי polycystin היוצר עם PKD2 קומפלקס בסיליות Crown cells ונדרש להעברת אות ה־Nodal flow. | סיליה / מנגנון תנועה | 14 |
| Left-sided Ca²⁺ signal | עלייה מוקדמת ב־Ca²⁺ בתאי Crown cells בצד שמאל של ה־Node, downstream של Nodal flow ושל PKD1L1/PKD2. | ציר ימין–שמאל | 13–14 |
| NVPs | Nodal vesicular parcels; השערה שלפיה שלפוחיות נושאות אות משתחררות אל חלל ה־Node ומוסטות שמאלה בזרם. | סיליה / מנגנון תנועה | 14 |
| Chemo-sensor hypothesis | השערה שלפיה הזרם מעביר מולקולת אות שמפעילה Crown cells בצד שמאל. | סיליה / מנגנון תנועה | 14 |
| Mechano-sensor hypothesis | השערה שלפיה כיפוף סיליות על ידי הזרם מפעיל מכנית את PKD1L1/PKD2. | סיליה / מנגנון תנועה | 14 |
| Cilia deflection | כיפוף מכני של סיליה עקב זרימת נוזל. | סיליה / חישה מכנית | 14 |
| Relay model | מודל חלופי שבו אות מן ה־Node מפעיל תאים סמוכים, וכל תא מעביר אות לתא הבא עד ה־LPM. | סיליה / מנגנון תנועה | 14 |
| Nodal gradient model | המודל הנתמך בשיעור: Nodal המופרש סביב ה־Node מתפשט ישירות אל ה־left LPM, ושם מפעיל ביטוי Nodal חדש. | ציר ימין–שמאל | 14 |
| Lateral plate mesoderm response | הפעלת Nodal בצד שמאל של ה־LPM לאחר האות מן ה־Node. | מזודרם → Lateral plate | 13–14 |
| Pitx2 | פקטור שעתוק downstream של Nodal המקבע זהות שמאלית באיברים. | ציר ימין–שמאל | 13–14 |
| Midline barrier | מחסום בקו האמצע, בעיקר Lefty1, המונע מעבר של אות שמאלי לצד ימין. | ציר ימין–שמאל | 13–14 |
| Reaction–diffusion | מודל דפוס שבו אקטיבטור קצר-טווח ומעכב המתפזר לטווח רחב יותר יוצרים הפעלה מקומית והגבלה לטרלית. | Nodal/Lefty - ארגון מרחבי | 14 |
| SELI | Self-enhancement and lateral inhibition: Nodal מחזק את ביטויו המקומי ומפעיל Lefty, שמתפזר רחוק יותר ומגביל את Nodal. | Nodal - מעכב | 14 |
| Activator | במודל reaction–diffusion: רכיב המחזק את יצירתו ואת תגובת הרקמה, כאן Nodal. | מסלול Nodal | 14 |
| Inhibitor | במודל reaction–diffusion: רכיב המתפזר ומגביל את האקטיבטור, כאן Lefty. | Nodal - מעכב | 14 |
| Responsiveness to Nodal | היכולת של תא להגיב לאות Nodal כאשר הוא נחשף אליו. | מסלול Nodal | 14 |
| Capability of expressing Nodal | היכולת המולקולרית של תא להפעיל את גן Nodal; אינה זהה לעצם הרגישות לאות. | מסלול Nodal | 14 |
| Situs solitus | סידור האיברים התקין מבחינת ימין–שמאל. | ציר ימין–שמאל תקין | 13 |
| Levocardia | מיקום תקין של חוד הלב בצד שמאל; המונח מתאר מיקום ולא בהכרח סידור תקין של כל האיברים. | ציר ימין–שמאל | 13 |
| Reversed looping | Looping של צינור הלב בכיוון ההפוך מן הכיוון התקין, היכול להופיע בשיבוש Nodal signaling. | ציר ימין–שמאל / לב | 13 |
| Situs inversus | היפוך מראה של מיקום איברים פנימיים. | קליני / פתולוגי | 13 |
| Heterotaxy | סידור לא אחיד או לא תקין של איברים לאורך ציר ימין–שמאל. | קליני / פתולוגי | 13 |
| Dextrocardia | מיקום הלב בצד ימין של בית החזה. | קליני / פתולוגי | 13–14 |
| Mesocardia | מיקום הלב בקו האמצע. | קליני / פתולוגי | 13–14 |
| Left isomerism | מצב שבו שני צדי הגוף מקבלים מאפיינים שמאליים. | קליני / פתולוגי | 13 |
| Right isomerism | מצב שבו שני צדי הגוף מקבלים מאפיינים ימניים. | קליני / פתולוגי | 13 |
| Kartagener syndrome | תת־קבוצה של Primary ciliary dyskinesia הכוללת מחלת דרכי נשימה, ולעיתים Situs inversus עקב פגיעה בסיליות מוטיליות. | קליני / פתולוגי | 13 |
| Primary ciliary dyskinesia (PCD) | מחלה גנטית של סיליות מוטיליות הגורמת לפגיעה בפינוי מוקוציליארי ולעיתים לאקראיות בציר ימין–שמאל. | קליני / פתולוגי | 13 |
| Cre-loxP | מערכת רקומבינציה שבה Cre מוחק DNA בין אתרי loxP ומאפשר knockout מותנה. | שיטת מחקר | 13 |
| Floxed allele | אלל שבו רצף מטרה מוקף אתרי loxP ומוכן למחיקה על ידי Cre. | שיטת מחקר | 13 |
| IRES | רצף המאפשר התחלת תרגום פנימית וייצור שני חלבונים מאותו תעתיק. | שיטת מחקר | 14 |
| FoxA2 regulatory element | רצף בקרה ששימש לביטוי טרנסגן בתאי ה־Node. | שיטת מחקר | 14 |
| NDE | Node distal enhancer; enhancer מתוך לוקוס Nodal שמכוון טרנסגן לאזור ה־perinodal ובעיקר ל־Crown cells. | שיטת מחקר | 14 |
| Venus | חלבון פלואורסצנטי ממשפחת YFP המשמש לסימון חלבון ומיקומו. | שיטת מחקר | 14 |
| PKD2 E442G | מוטציה שבה התעלה יכולה לפעול אך אינה מגיעה כראוי לסיליה; היא אינה מצילה את פנוטיפ PKD2 knockout. | סיליה / תעלת PKD2 | 14 |
| PKD2 D509V | מוטציה הפוגעת גם במיקום PKD2 בסיליה וגם בתפקוד התעלה, ולכן אינה מבצעת rescue. | סיליה / תעלת PKD2 | 14 |