פרטים כללים (על בסיס הסילבוס)
- סוג הקורס
- שיעור + תרגיל
- מספר קורס
- 81449
- נקודות זכות
- 4 נ"ז
- שנת לימודים
- תשפ"ו
- סמסטר
- א׳
- ימים ושעות
- ימי א׳ ה׳ בשעות 10:15-12:00
- מרצים
- פרופ׳ משה דסאו, ד״ר רון אורבך
- שעת קבלה
- יום ראשון 16:00-18:00 (פרופ׳ משה דסאו)
- מייל
- moshe.dessau@biu.ac.il, ron.orbach@biu.ac.il
- אתר למדה
- קישור לאתר הקורס
"קורס זה נועד להקנות לסטודנטים לרפואה הבנה מעמיקה ויסודית של עקרונות הביוכימיה, תוך התמקדות במבנה ותפקוד של חלבונים, מנגנוני פעולה של אנזימים, והמסלולים המטבוליים המרכזיים המתרחשים בגוף האדם. נושאים אלו נלמדים תוך שימת דגש על הרמה המולקולרית ועל הרמה המכניסטית של תהליכים ביוכימיים בתנאים פיזיולוגיים ופתולוגיים כאחד."
יעדי הלמידה
ידע
- הכרת הנושאים והתחומים בהם עוסקת הביוכימיה ומושגים בסיסיים במבנה ותפקוד של מקרומולקולות
- הבנת איך מתבצעת קטליזה אנזימטית ועקרונות יסוד בקינטיקה אנזימטית של מיכאליס מנטן
- תיאור מסלולי הקטבוליזם והאנבוליזם השונים והיחסי הגומלין בין המסלולים השונים בבריאות ובמצבי מחלה
- הבנת מושגים בסיסיים במטבוליזם והבקרה על המסלולים השונים
- הכרת תהליכי הבקרה על המסלולים השונים והשפעת הרקמה והאיבר על המטבוליזם התאי
מיומנויות
- נתח מבנה חלבונים - הבנת כיצד המבנה הראשוני, השניוני, השלישוני והרביעוני משפיע על תפקוד החלבון
- נתח תוצאות של ניסויי אנזימטיקה - זיהוי פרמטרים מרכזיים כמו Km ו-Vmax והסקת מסקנות על מנגנון הפעולה
- אפיון השפעת מעכבים שונים - הבחנה בין סוגי עיכוב (תחרותי, לא תחרותי, בלתי הפיך ועוד)
- נתח מסלולים מטבוליים מרכזיים - הכרה לעומק של שלבי הגליקוליזה, מעגל החומצה הציטרית, ונתיבי פירוק וסינתזה
- הערכת מצבים מטבוליים שונים - ניתוח תרחישים קליניים ופענוח התהליכים המטבוליים המעורבים
תכנית הלימודים
| שבוע | נושא | עמודים | תאריך |
|---|---|---|---|
| 1 | מים, בופרים, משוואת הנדרסון-הסלבלך חומצות אמינו כחומצות ובסיסים חלשים, סטריאו-איזומרים, עקומת טיטרציה, הקשר הפפטידי, נקודה איזואלקטרית | Lehninger 59-63, 70-83 Stryer 33-40 | 23/10/2025 |
| המבנה הראשוני של חלבונים ריצוף פפטידים (שיטת אדמן), ספקטרוסקופיית מסות, חשיבות ביוכימית של רצפי פפטידים | Lehninger 90-98 Stryer 41-44, 118-125 | 26/10/2025 | |
| תרגול 1 | 27/10/2025 | ||
| 2 | סקירת מבנה חלבונים מבנים שניוניים, מבנים שלישוניים, מבנים רביעוניים, דנטורציה וקיפול חלבונים | Lehninger 106-134 Stryer 41-55 | 30/10/2025 |
| הפרדת חלבונים כרומטוגרפיה (חילוף יונים, SEC, אפיניות) ואלקטרופורזה (SDS-PAGE), כימות חלבונים | Lehninger 115-156 Stryer 100-112 | 2/11/2025 | |
| תרגול 2 | 3/11/2025 | ||
| 3 | תפקוד חלבונים קישור ליגנד הפיך (Hb-O2/CO2), אינטראקציות משלימות (נוגדן-אנטיגן), אינטראקציות חלבונים המווסתות על ידי אנרגיה כימית | Lehninger 147-170 Stryer 68-94 | 6/11/2025 |
| אנזימים קצב תגובה אנזימטית, תרמודינמיקה ושיווי משקל. מצב מעבר, אנרגיית קישור וספציפיות/קטליזה. קינטיקה אנזימטית (מודל מיכאליס-מנטן), מנגנוני עיכוב | Lehninger 177-201 Stryer 141-172 | 9/11/2025 | |
| תרגול 3 | 10/11/2025 | ||
| 4 | דוגמאות לתגובות אנזימטיות כימוטריפסין כמודל, מנגנון induced fit של הקסוקינאז, ליזוזים ואנולאז | Lehninger 203-223 Stryer 180-189, 210-216 | 13/11/2025 |
| אנזימים רגולטוריים אנזימים אלוסטריים, קינטיקה אלוסטרית, מודיפיקציות קוולנטיות הפיכות, ביקוע פרוטאוליטי כמנגנון ויסות, מפל פרוטאוליטי של קרישת הדם | Lehninger 226-242 | 16/11/2025 | |
| תרגול 4 | 17/11/2025 | ||
| 5 | ממברנות ביולוגיות ליפידים לאחסון, ליפידים כאלמנטים מבניים בממברנות, ממברנות ביולוגיות והדינמיקה שלהן, העברת מומסים דרך ממברנות | Lehninger 367-389 Stryer 352-375, 381-394 | 20/11/2025 |
| פחמימות מונו- ודי-סכרידים, פוליסכרידים, פוליסכרידים כאחסון | Lehninger 229-258 Stryer 324-347 | 23/11/2025 | |
| תרגול 5 | 24/11/2025 | ||
| 6 | בוחן אמצע + דיון | 27/11/2025 | |
| ביו-אנרגטיקה וסוגי תגובות ביוכימיות מבוא למטבוליזם | Lehninger 465-487, 496-502 Stryer 446-467 | 30/11/2025 | |
| תרגול 6 | 1/12/2025 | ||
| 7 | גליקוליזה נתיבי הזנה לגליקוליזה, תסיסה, גלוקונאוגנזה ונתיב הפנטוז פוספט | Lehninger 510-538, 546-555 Stryer 469-501, 609-636 | 4/12/2025 |
| ויסות מטבולי ויסות גליקוליזה וגלוקונאוגנזה, עקרונות במטבוליזם גליקוגן | Lehninger 539-545, 556-573 Stryer 502-514, 637-662 | 7/12/2025 | |
| תרגול 7 | 8/12/2025 | ||
| 8 | פירובט ל-Acetyl-CoA מחזור החומצה הציטרית, ויסות מחזור החומצה הציטרית | Lehninger 574-600 Stryer 515-542 | 11/12/2025 |
| זרחון חמצוני פוטנציאל Red-Ox, העברת אלקטרונים במיטוכונדריה | Lehninger 659-674 Stryer 543-560 | 14/12/2025 | |
| תרגול 8 | 15/12/2025 | ||
| 9 | סינתזת ATP ויסות זרחון חמצוני, מיטוכונדריה בתרמוגנזה, גורל NADH ציטוזולי (מעבורת מאלאט-אספרטט) | Lehninger 674-699 Stryer 561-584 | 25/12/2025 |
| גורלים מטבוליים של קבוצות אמינו מחזור האוריאה | Lehninger 625-638 Stryer 697-728 | 28/12/2025 | |
| תרגול 9 | 29/12/2025 | ||
| 10 | קטבוליזם של חומצות שומן עיכול, גיוס והובלה של שומנים (טריאצילגליצרול), חמצון חומצות שומן, גופי קטון | Lehninger 601-624 | 1/1/2026 |
| ויסות קטבוליזם כולל | 4/1/2026 | ||
| תרגול 10 | 5/1/2026 | ||
| 11 | ביוסינתזה של ליפידים סינתזת טריאצילגליצרול | Lehninger 744-763 | 8/1/2026 |
| פוספוליפידים ממברנליים, כולסטרול, סטרואידים ביוסינתזה, ויסות והובלה | Lehninger 764-787 | 11/1/2026 | |
| תרגול 11 | 12/1/2026 | ||
| 12 | ביוסינתזה של חומצות אמינו סקירה של מטבוליזם חנקן, עקרונות ביוסינתזה של חומצות אמינו | Lehninger 795-814 | 15/1/2026 |
| מולקולות הנגזרות מחומצות אמינו | Lehninger 817-822 | 18/1/2026 | |
| תרגול 12 | 19/1/2026 | ||
| 13 | הורמונים - מבנה ותפקוד מטבוליזם ספציפי לרקמה | Lehninger 842-857 | 22/1/2026 |
| ויסות הורמונלי של מטבוליזם דלק | Lehninger 859-865 | 25/1/2026 | |
| תרגול 13 | 26/1/2026 | ||
| 14 | השמנת יתר וויסות מסת גוף פתולוגיה מטבולית (סוכרת, רעב וכו׳) | Lehninger 867-878 | 29/1/2026 |
| חזרה לבחינה | 1/2/2026 |
הערכה והרכב הציון
- בוחן אמצע (מגן)
- 25%
- בחינה מסכמת
- 75%
הערות חשובות:
• ציון עובר בבוחן ובבחינה – 60. ציון עובר בקורס – 60
• חובת עמידה בבחינה הסופית. ללא עמידה בבחינה המסכמת לא ניתן להעביר את הקורס
• לבוחן האמצע לא יהיה מועד ב׳ (יהיה מועד מיוחד למילואימניקים בלבד)
• במידה וסטודנט לא ניגש לבוחן המגן, הציון הסופי יתבסס על הבחינה המסכמת בלבד
דרישות הקורס
- דרישות קדם
- • כימיה כללית ופיסיקלית (81441)
• כימיה אורגנית לרפואנים (81442)
• ביולוגיה של התא (81447) - נוכחות
- חובת נוכחות של לפחות 80% מהשיעורים. סטודנט שלא יעמוד בכסת הנוכחות לא יוכל לגשת לבחינה
- תרגילים
- אין חובת הגשה של תרגילי הבית
- הכנה מומלצת
- מומלץ לחזור על הנושאים: Chemical, physical, evolutionary and genetic foundations. Weak interactions in aqueous solutions, Weak acids and bases, definition of pKa and pH
ביבליוגרפיה
התכנים בקורס מתבססים על שני הספרים הבאים:
ספרי לימוד:
- Lehninger, A.L. (2021) Principles of Biochemistry, 8th edition. W.H. Freeman.
- Stryer, L. (2023) Biochemistry, 10th edition. W.H. Freeman.
קריאת רקע מומלצת:
- עמודים 2-36 בספר Lehninger's Principles of Biochemistry, 8th edition